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13.6 : Systèmes de réaction-diffusion


Enfin, je voudrais vous présenter systèmes de réaction-diffusion, une classe particulière de modèles de champ continu qui ont été largement étudiés. Ce sont des modèles à champ continu dont les équations ne sont constituées que de termes de réaction et termes de diffusion, comme indiqué ci-dessous:

[dfrac{partial{f_1}}{partial{t}} =R_1(f_1,f_2,...,f_n) + D_1∇^{2}f_1 label{(13.53)} ]

[dfrac{partial{f_2}}{partial{t}} = R_2 (f_1,f_2,...,f_n) + D_2∇^{2}f_2 label{(13.54)} ]

[ vdots]

[dfrac{partial{f_n}}{partial{t}} =R_n(f_1,f_2,...,f_n) + D_n∇^{2}f_n label{(13.55)} ]

Les termes de réaction ((R_i(...))) ne décrivent que des dynamiques locales, sans aucune dérivée spatiale impliquée. Les termes de diffusion ((D_i∇^{2}f_i)) sont strictement limités au laplacien de la variable d'état elle-même. Par conséquent, toutes les équations qui impliquent un mouvement spatial non diffusif (par exemple, la chimiotaxie) ne sont pas des systèmes de réaction-diffusion.

Il y a plusieurs raisons pour lesquelles les systèmes de réaction-diffusion ont été un choix populaire parmi les modélisateurs mathématiques de phénomènes spatio-temporels. Premièrement, leur séparation claire entre dynamique non spatiale et dynamique spatiale rend les tâches de modélisation et de simulation vraiment faciles. Deuxièmement, en limitant le mouvement spatial à la diffusion, il est assez simple d'étendre tous les modèles dynamiques non spatiaux existants en modèles spatialement distribués. Troisièmement, la structure particulière des équations de réaction-diffusion fournit un raccourci facile dans l'analyse de stabilité (qui sera discutée dans le chapitre suivant). Et enfin, malgré la simplicité de leur forme mathématique, les systèmes de réaction-diffusion peuvent montrer des dynamiques spatio-temporelles d'une richesse et d'une complexité saisissantes. En raison de ces propriétés, les systèmes de diffusion par réaction ont été largement utilisés pour modéliser l'auto-organisation des modèles spatiaux. Il existe même des applications logicielles spécialisées disponibles pour simuler exactement les systèmes de réaction-diffusion3.

Exercice (PageIndex{1})

Étendez les modèles non spatiaux suivants à des modèles spatialement distribués en tant que systèmes de réaction-diffusion en ajoutant des termes de diffusion. Ensuite, simulez leurs comportements en Python.

  • Mouvement d'un pendule (Eq.(6.2.1)): Cela crée un modèle spatial d'oscillateurs non linéaires couplés localement.
  • Modèle Susceptible-Infected-Recovered (SIR) (Exercice 7.1.3) : Ceci crée un modèle spatial de la dynamique épidémiologique.

Dans ce qui suit, nous passerons en revue quelques systèmes de réaction-diffusion bien connus pour avoir un aperçu du monde riche et diversifié de leur dynamique.

Formation du motif de Turing

Comme mentionné au tout début de ce chapitre, les modèles PDE d'Alan Turing ont été parmi les premiers systèmes de réaction-diffusion développés au début des années 1950 [44]. Une version linéaire simple des équations de Turing est la suivante :

[dfrac{partial{u}}{partial{t}} =a(u-h) +b(v-k) +D_{u}Delta^{2}u label{13.56}]

[dfrac{partial{u}}{partial{t}} =c(u-h) +d(v-k) +D_{u}Delta^{2}u label{13.57}]

Les variables d'état (u) et (v) représentent les concentrations de deux espèces chimiques. (a, b, c,) et (d) sont des paramètres qui déterminent le comportement des termes de réaction, tandis que (h) et (k) sont des constantes. Enfin, (D_u) et (D_v) sont des constantes de diffusion.

Si les termes de diffusion sont ignorés, il est facile de montrer que ce système n'a qu'un seul point d'équilibre, ((u_eq,v_eq) = (h,k)). Ce point d'équilibre peut être stable pour de nombreuses valeurs de paramètres pour (a, b, c,) et (d). Ce qui était le plus surprenant dans les découvertes de Turing, c'est que, même pour de tels points d'équilibre stables, l'introduction de dimensions spatiales et de termes de diffusion dans les équations peut déstabiliser l'équilibre, et ainsi le système peut s'auto-organiser spontanément en un modèle non homogène. C'est appelé instabilité induite par la diffusion ou alors Instabilité de Turing. Un exemple de résultat de simulation est illustré à la Fig. 13.6.1.

L'idée d'instabilité induite par la diffusion est assez contre-intuitive. La diffusion est généralement considérée comme une force aléatoire qui détruit toute structure en un désordre homogénéisé, mais dans ce modèle particulier, la diffusion est la clé de l'auto-organisation ! Que se passe-t-il? L'astuce est que ce système a deux coefficients de diffusion différents, (D_u) et (D_v), et leur différence joue un rôle clé dans la détermination de la stabilité de l'état du système. Ceci sera discuté plus en détail dans le prochain chapitre.

Il y a une chose qui nécessite une attention particulière lorsque vous êtes sur le point de simuler les équations de réaction-diffusion de Turing. La formation du motif de Turing nécessite la présence de petites perturbations aléatoires (bruit) dans la configuration initiale du système ; sinon, il n'y aurait aucun moyen pour la dynamique de briser la symétrie spatiale pour créer des motifs non homogènes. En attendant, ces perturbations initiales doivent être suffisamment petites pour qu'elles ne provoquent pas immédiatement des instabilités numériques dans la simulation. Voici un exemple de code pour simuler la formation d'un motif de Turing avec un niveau suggéré de perturbations initiales, en utilisant les paramètres indiqués sur la figure 13.6.1 :

Cette simulation part d'une configuration initiale ((u(x,y),v(x,y)) ≈ (1,1) = (h,k)), qui est l'état d'équilibre homogène du système qui serait stable sans termes de diffusion. Exécutez la simulation pour voir comment les modèles s'auto-organisent spontanément !

Exercice (PageIndex{2})

Effectuez des simulations de la formation du motif de Turing avec plusieurs réglages de paramètres différents et discutez de la manière dont les variations des paramètres (en particulier pour les constantes de diffusion) affectent la dynamique résultante.

Exercice (PageIndex{3})

Discrétisez le modèle d'agrégation de moisissure visqueuse de Keller-Segel (Éq. (13.4.13) et (13.4.14)) (bien que ce modèle ne soit pas un système de réaction-diffusion, c'est le moment idéal pour vous de travailler sur cet exercice car vous peut utiliser le code 13.8). Implémentez son code de simulation en Python et effectuez des simulations avec (µ = 10^{−4}), (D = 10^{−4}), (f = 1) et (k = 1), en faisant varier (χ) comme paramètre de contrôle allant de (0) à (10^{−3}). Utilisez (a = 1) et (c = 0) comme conditions initiales partout, en y ajoutant de petites perturbations aléatoires.

Réaction de Belousov-Zhabotinsky

Le Réaction de Belousov-Zhabotinsky, ou alors réaction BZ pour faire court, est une famille de réactions chimiques oscillatoires découvertes pour la première fois par le chimiste russe Boris Belousov dans les années 1950, puis analysées plus tard par le chimiste russo-américain Anatol Zhabotinsky dans les années 1960. L'une des variations courantes de cette réaction est essentiellement une oxydation de l'acide malonique ((CH_{2}(COOH)_{2})) par une solution de bromate acidifiée, mais ce processus montre un comportement oscillatoire non linéaire ou une longueur substantielle de temps avant d'atteindre finalement l'équilibre chimique. Le mécanisme chimique réel est assez complexe, impliquant environ 30 produits chimiques différents. De plus, si cette solution chimique est placée dans une boîte de Pétri peu profonde, l'oscillation chimique commence en différentes phases à différents endroits. L'interaction entre la réaction et la diffusion des produits chimiques dans l'espace entraînera l'auto-organisation d'ondes progressives dynamiques (Figure (PageIndex{2})), tout comme celles observées dans le modèle CA des médias excitables de la section 11.5. .

Un modèle mathématique simplifié appelé « Orégonator » a été parmi les premiers à décrire la dynamique de la réaction BZ sous une forme simple [50]. Il a été proposé à l'origine comme un modèle non spatial avec trois variables d'état, mais le modèle a ensuite été simplifié pour n'avoir que deux variables, puis étendu aux domaines spatiaux [51]. Voici les équations « Oregonator » simplifiées :

[ egin{align} epsilon{dfrac{partial{u}}{partial{t}}} &= u(1-u)-dfrac{uq}{u+q}fv + D_{ u}Delta^{2}u label{(13,58)} [4pt] dfrac{∂v}{∂t} &=uv + D_{u}Delta^{2}v label{( 13.59)} end{align}]

Ici, (u) et (v) représentent les concentrations de deux espèces chimiques. Si vous examinez attentivement les termes de réaction de ces équations, vous remarquerez que la présence du produit chimique (u) a un effet positif sur (u) et (v), tandis que la présence du produit chimique (v) a un effet négatif sur les deux. Par conséquent, ces produits chimiques sont appelés respectivement « activateur » et « inhibiteur ». Des interactions similaires entre l'activateur et l'inhibiteur ont également été observées dans la formation du motif de Turing, mais le système de réaction BZ montre une oscillation chimique non linéaire. Cela provoque la formation d'ondes progressives. Parfois, ces ondes peuvent former des spirales si la symétrie spatiale est brisée par des facteurs stochastiques. Un exemple de résultat de simulation est illustré à la Fig. 13.6.3.

Exercice (PageIndex{5})

Implémenter un code simulateur du modèle « Oregonator » de la réaction BZ en Python. Ensuite, effectuez des simulations avec plusieurs réglages de paramètres différents et discutez du type de conditions nécessaires pour produire des ondes progressives.

Formation du motif Gray-Scott

Le dernier exemple est le Modèle Gray-Scott, un autre système de réaction-diffusion très connu étudié et popularisé par John Pearson dans les années 1990 [52], basé sur un modèle de réaction chimique développé par Peter Gray et Steve Scott dans les années 1980 [53, 54, 55]. Les équations du modèle sont les suivantes :

[ dfrac{∂u}{∂t} =F(1-u) -uv^{2} +D_{u}Delta^{2}u label{(13.60)} ]

[dfrac{∂v}{∂t} =-(F+k)v +uv^{2}+ D_{u}Delta^{2}v label{(13.61)} ]

Les termes de réaction de ce modèle supposent ce qui suit réaction autocatalytique (c'est-à-dire, réaction chimique pour laquelle le réactif lui-même sert de catalyseur) :

[u+2v ightarrow 3v label{(13.62)}]

Cette réaction prend une molécule de (u) et la transforme en une molécule de (v), à l'aide de deux autres molécules de (v) (d'où l'autocatalyse). Ceci est représenté par le deuxième terme de chaque équation. Pendant ce temps, (u) est continuellement reconstitué à partir de la source externe jusqu'à 1 (le premier terme de la première équation) à la vitesse d'alimentation (F), tandis que (v) est continuellement retiré du système à un taux légèrement plus rapide que la reconstitution de (u) ((F +k )vu dans le premier terme de la deuxième équation). (F) et (k) sont les paramètres clés de ce modèle.

Il est facile de montrer que, si les termes de diffusion sont ignorés, ce système a toujours un point d'équilibre à ((u_{eq},v_{eq}) = (1,0)) (qui est stable pour tout (F) et (k)). Étonnamment, cependant, ce modèle peut montrer une dynamique d'aspect biologique très exotique si certains modèles spatiaux sont placés dans l'équilibre ci-dessus. Ses comportements sont étonnamment riches, y compris même la croissance, la division et la mort des « cellules » si les valeurs des paramètres et les conditions initiales sont choisies de manière appropriée. Voir Fig. 13.6.4 pour ne voir que quelques échantillons de sa merveilleuse dynamique !

Exercice (PageIndex{5})

Implémenter un code de simulation du modèle Gray-Scott en Python. Ensuite, effectuez des simulations avec plusieurs réglages de paramètres différents et discutez de la manière dont les paramètres affectent les modèles résultants.

Figure (PageIndex{4}): (Page suivante) Exemples de motifs générés par le modèle de Gray-Scott avec (D_u = 2 × 10^{−5}) et (D_v = 10^{−5}). La concentration du produit chimique (u) est représentée en niveaux de gris (plus clair = plus élevé, uniquement sur cette figure). Le temps s'écoule de gauche à droite. Les valeurs des paramètres de (F) et (k) sont affichées au-dessus de chaque résultat de simulation. Les conditions initiales sont l'équilibre homogène ((u,v) = (1,0)) partout dans l'espace, sauf au centre où l'état local est inversé tel que ((u,v) = (0, 1)).

3Par exemple, consultez Prêt (https://code.google.com/p/reaction-diffusion/).


Modélisation de la transmission de la rage dans des environnements spatialement hétérogènes via ( heta ) -diffusion

La rage chez les chiens reste un risque considérable pour l'homme et constitue un grave problème de santé publique dans de nombreuses régions du monde. Les modèles mathématiques conventionnels pour la rage supposent généralement des environnements homogènes, avec un terme de diffusion standard pour la population d'animaux enragés. Il a été récemment reconnu, cependant, que l'hétérogénéité spatiale joue un rôle important dans la détermination des schémas spatiaux de la rage et la rentabilité des vaccinations. Dans cet article, nous développons un modèle de rage canine spatialement hétérogène en utilisant l'équation de diffusion ( heta ) , où ( heta ) reflète la façon dont les chiens individuels prennent des décisions de mouvement dans la marche aléatoire sous-jacente. Nous étudions numériquement la dynamique du modèle dans trois cas de diffusion : homogène, urbain sauvage et de type gaussien. Nous constatons que les conditions initiales affectent si des ondes progressives ou des ondes épizootiques peuvent être observées. Cependant, des conditions initiales différentes ont peu d'impact sur les solutions en régime permanent. Une interface « active » est observée entre la ville et les régions sauvages, avec une « crête » côté ville et une « vallée » côté sauvage pour la population canine contagieuse. De plus, la vitesse de progression des ondes épizootiques change dans des environnements hétérogènes. Il est impossible d'éliminer la rage dans tout le domaine spatial si la vaccination est focalisée uniquement dans la région urbaine ou uniquement dans la région sauvage. Lorsqu'une transmission saisonnière est incorporée, la taille de la population canine s'approche finalement d'un état spatio-temporel positivement hétérogène.

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Revue SIAM sur l'analyse mathématique

Cet article étudie la propagation des fronts d'onde dans une réaction chimique isotherme $ A + 2B ightarrow 3B$ impliquant deux espèces chimiques, un réactif UNE et un autocatalyseur B, dont les coefficients de diffusion, $D_A$ et $D_B$, sont inégaux en raison de poids moléculaires et/ou de tailles différents. Les limites explicites $v_*$ et $v^*$ qui dépendent de $D_B/D_A$ sont dérivées de telle sorte qu'il existe une onde progressive unique de chaque vitesse $v geq v^*$ et qu'il n'existe aucune onde progressive de vitesse $v<v_*$. Nouveau dans la littérature, il est montré que $v_*propto v^* propto D_B/ D_A$ lorsque $D_B leq D_A $. De plus, lorsque $D_A leq D_B$, on montre rigoureusement qu'il existe un $v_$ tel qu'il existe une onde progressive de vitesse v si et seulement $v geq v_$. Les estimations sur $v_$ améliorent considérablement celles des premiers travaux. Le cadre est construit sur des réactions chimiques autocatalytiques isothermes générales $A + n B ightarrow (n+1) B$ d'ordre arbitraire $n geq 1$.


Brevets

"Telerobotic System", brevet U.S. 5266875, 30 novembre 1993, G. Niemeyer et J.J.E. Slotine

"Stable Adaptive Neural Network Controller and Recursive Identifier", brevet américain 5268834, 7 décembre 1993, R. Sanner et J.J.E. Slotine

"Téléopération haptique sur Internet", brevet américain 6144884, 7 novembre 2000, G. Niemeyer et J.J.E. Slotine

« Controllers for Nonlinear Chemical Processes », brevet allemand, 2002, W. Lohmiller et J.J.E. Slotine

"Observers for Nonlinear Chemical Processes", brevet allemand, 2002, W. Lohmiller et J.J.E. Slotine

"Static and Dynamic Foveating Vision System", brevet américain 7173662, 6 février 2007, G. Barbasthatis et J.J.E. Slotine

"Active Control Vibration Isolation Using Dynamic Manifold", brevet américain 7216018, 8 mai 2007, J.J.E. Slotine et L. Zuo

"Classification de modèle rapide basée sur une transformation creuse", brevet américain 8553984, 8 octobre 2013, J.J.E. Slotine et G. Yu

&copier 2010 Institut de technologie du Massachusetts
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Figure 2

Figure 2. Conception d'une lignée cellulaire rapporteur sensible au HGF. HGF induit la fluorescence verte et la tubulation dans les kystes MDCK-MMP-1-d2EGFP. (a–h) Un kyste a été traité avec 10 ng/mL de HGF pendant 16 h. Les images ont été prises toutes les deux heures après l'ajout de HGF. Notez la faible fluorescence basale dans les kystes MDCK en culture 3D (panneau a). Un kyste typique est montré et peut également être vu en timelapse (Supporting Information Movie S1). Barres d'échelle, 50 m.


ات

. لاوه اعد اجرا املات ان اجزاء براساس اطلاعات ارجاع الگوی کلی، تعیین می‌شود. [۵]

ازمان‌دهی ا خودجوش (در علوم اجتماعی) ایندی است که شکلی از نظم از اثرات متقابل بین ای یک سیستم اولیه، پدیدار می‌شود. این ایند ل عامل از ندارد. اغلب این ایند ا انات ادفی از ا ازخوردهای تقویت می‌شود. ازمان املاً است امی اجزای توزیع شده‌است. این ازمان اً قابلیت نجات پس از آشفتگی‌های قابل توجه را دارد. خودسازماندهی ا ابه جزایر دریای ناپذیر می‌داند.

ازماندهی اری ای ایی، اتیک شناختی رخ می‌دهد. ای می‌توان بلوری نوسان (اوسیلاسیون) ایی، ار حیوانات شبکه مصنوعی اشاره کرد.

ازماندهی در فیزیکایندهای ادلی اکنش‌های ایی افته و در آن‌ها ا نام امتزاجی شناخته می‌شود. ا اسی از لکولی ا اکوسیستمی، بسیار است. اری مثال‌های ارهای خود سازماندهانه ادبیات رشته‌ها هم می‌باشد، هم در علوم طبیعی و هم علوم اجتماعی همچون اقتصاد و انسان‌شناسی. ازمان سیستم‌های اضیاتی انند اتوماتای ​​سلولی دیده شده‌است. ازماندهی ا اید ا اری اشتباه کرد.

ازمان سه اصلی استوار است:

  1. امیک، اغلب لزوماً شامل بازخورد منفی نباشد.
  2. ادل بین استثمار و اکتشاف
  3. املات چندگانه

ای لیام اس اشبی، سایبرنتیک، ال ۱۹۴۷ اصول اولیه ازمان را تدوین کرد. ان که سیستم دینامیک قطعی به صورت اتوماتیک سمت تعادل حرکت می‌کند و ان آن را شکل جاذبی از حالات اطراف توصیف نمود. انی این امل ادامه باید جاذب باشد. ا لی از وابستگی ا اری ا اجزای ل ا ایش می‌رساند. اشبی، ا ل امی زیرسیستم‌های پیدا می‌کند.

ای انتس ایبرنتیک، اصول از ا سال تدوین نمود. ان سازمان آشفتگی‌های ادفی که اجازه اکتشاف حالات مختلف فضای حالت را به سیستم می‌دهند، تسهیل می‌شود. این امر باعث الارفتن انس رسیدن جاذب یا می‌شود از این ظرف می‌تواند وارد جاذب شود. ایلیا امیکیست، اصل ابهی ا ان نظم از نوسانات ا برآمده از تدوین نمود. این اصل ازی لینگ ای ل له اشین بکار رفته‌است.

یادگیری ویرایش

اغلب ادر ان یادگیری ادگیری به این است ا بیاموزیم تعلیم ببینند. ادگیری ازماندهانه اینکه متخصص بهتر می‌داند ا اینکه بهترین شیوه‌ای دارد، را می‌کند و ای آن اخت معنی اندنی و ز ا ادگیرنده اآزمونده. این امر می‌تواند از همکاری ا پاداش باشد. این ایند، فرایندی همیشگی است محیط یادگیری اصی (دانشگاه، مدرسه، خانه) و تحت ل سلطه گرانی اولیا استادان نمی‌باشد. لازم است این ایند از یادگیرنده شود و متناوباً تجدید قرار لازم نیست با ان یا هوشیاری محدود شود. اپرا این تعلیم روانشناسی شناخته نشده‌است. از ا امل لوپ ل بازخورد است می‌تواند سایبرنتیک یا ا باشد. ازماندهی اند المه ا الوگ یادگیری یادگیرندگان ا انجام شود.

زبان‌شناسی ویرایش

ا املات اری ا ا تکامل بیولوژیکی، امل زبان ظاهر شده‌است.

اصول و شیوه‌های خودسازمان‌یابی را می‌توان امیک ایجاد، تکامل، و لکرد تمامی پدیده‌های پیچیدهٔ جهان (هم درونی، و هم ) و نیز، بر روش‌های مدل‌سازی و ا ا


13.6 : Systèmes de réaction-diffusion

Département d'ingénierie, mathématiques et physique, Faculté d'ingénierie, Université de Zagazig, Zagazig, Égypte

Reçu le 22 novembre 2013 révisé le 22 décembre 2013 accepté le 29 décembre 2013

Dans cet article, une technique efficace de méthode de quadrature différentielle et de méthode de perturbation est utilisée pour analyser les problèmes de réaction-diffusion. Une méthode efficace est présentée pour résoudre le modèle de propagation des ondes thermiques en une et deux dimensions. La méthode proposée marche dans le sens du temps bloc par bloc et il y a plusieurs niveaux de temps dans chaque bloc. La méthode globale de quadrature différentielle est appliquée dans chaque bloc pour discrétiser à la fois les dérivées spatiales et temporelles. De plus, la méthode proposée est validée en comparant les résultats obtenus avec les résultats analytiques disponibles et également par rapport à la technique hybride de la méthode de quadrature différentielle et de la méthode du quatrième ordre de Runge-Kutta.

Mots clés:Bloc de réaction-diffusion Marche Différentiel Perturbation en quadrature

L'onde thermique est l'équation de réaction-diffusion qui joue un rôle de plus en plus important dans l'étude des paramètres des matériaux. Il a été utilisé dans des études optiques de solides, de liquides et de gaz avec la spectroscopie photo-acoustique et thermique des lentilles. Les ondes thermiques ont également été utilisées pour analyser les propriétés thermiques et thermodynamiques des matériaux et pour imager les caractéristiques thermiques et matérielles d'un échantillon solide [1].

Au cours des dernières décennies, il y a eu une activité salutaire dans le développement de méthodes numériques et analytiques pour l'équation des ondes thermiques. En raison de la non-linéarité et de la complexité de tels problèmes, seuls des cas limités peuvent être résolus analytiquement [2-5]. Yan a appliqué la méthode de l'équation projective de Riccati pour résoudre l'équation de Schrödinger dans les fibres optiques non linéaires [2]. Ensuite, Mei, Zhang et Jiang ont utilisé la même méthode pour obtenir les solutions exactes de certains problèmes de réaction-diffusion [3]. Abdusalam a appliqué une technique de factorisation pour trouver des solutions exactes d'ondes progressives [4]. Chowdhury et Hashim obtiennent une solution analytique pour les problèmes de réaction-diffusion de Cauchy en utilisant la méthode de perturbation d'homotopie [5]. La littérature sur la résolution numérique des équations de réaction-diffusion est éparse. La méthode de perturbation singulière a été appliquée pour résoudre les équations de réaction-diffusion par Puri et al. dans [6]. David, Curtis et John ont introduit des méthodes d'intégration temporelle pour résoudre la propagation des ondes thermiques [7]. Marcus a appliqué la méthode des différences finies pour étudier la dynamique des interactions prédateur-proie [8], et Chen et al. ont utilisé la méthode des éléments finis pour résoudre les équations de réaction-diffusion advective [9]. Puis Christos et al. appliqué également la même méthode pour résoudre le problème avec les couches limites [10]. Meral et Sezgin ont utilisé cette méthode et la méthode des différences finies avec un paramètre de relaxation pour résoudre l'équation de réaction-diffusion non linéaire en une et deux dimensions [11]. Récemment, la méthode de quadrature différentielle a été efficacement utilisée dans une variété de problèmes d'ingénierie [12]. Wu et Liu ont introduit la généralisation de la méthode de quadrature différentielle pour résoudre des équations différentielles linéaires et non linéaires [13]. De plus, Meral a appliqué la méthode de quadrature différentielle et la méthode implicite d'Euler pour résoudre l'équation de réaction-diffusion non linéaire dépendante de la densité [14]. Kajal a appliqué la quadrature différentielle et la méthode de Runge-Kutta pour résoudre les ondes thermiques, une explosion et un système de dynamique chimique de Brusselator [15]. Kajal a atteint une précision élevée, mais la méthode précédente présente certaines difficultés selon lesquelles la solution numérique est obtenue couche par couche dans le sens du temps, de sorte que l'on peut s'attendre à ce que la précision de la solution numérique diminue avec le temps en raison de l'accumulation d'erreurs numériques, également Un schéma explicite est utilisé pour mettre à jour la solution en utilisant une très petite taille de pas en raison de la limitation de la condition de stabilité. De plus, Salah, Rania et Matbuly ont résolu l'équation des ondes thermiques en une et deux dimensions en utilisant la méthode implicite d'Euler et de perturbation. Ils ont comparé la solution numérique avec les résultats de la méthode de Runge-Kutta. Ils surmontent la limitation de la stabilité et on peut utiliser des pas de grande taille [16]. Shu et al. technique de marche de bloc présentée au début avec discrétisation DQ pour obtenir la solution dans le sens du temps bloc par bloc pour surmonter la difficulté ci-dessus. De plus, ils ont utilisé une méthode itérative de sur-relaxation successive (SOR) pour compléter la solution en obtenant une précision et une efficacité élevées [17].

Dans ce bloc de recherche, la marche dans le temps et la discrétisation DQ dans les dérivées spatiales et temporelles sont appliquées pour obtenir la solution dans la direction du temps bloc par bloc pour l'équation des ondes thermiques. Dans chaque bloc, il y a plusieurs niveaux de temps (couches).L'erreur d'accumulation est donc bloc par bloc au lieu de couche par couche. La méthode de perturbation est utilisée pour compléter la solution. Les résultats obtenus sont comparés aux précédents analytiques et également comparés à la technique hybride de la méthode de quadrature différentielle et de la méthode du quatrième ordre de Runge-Kutta [15].

2. Procédure numérique de l'onde thermique

La stratégie principale consiste à appliquer la méthode de perturbation du second ordre [18,19] puis à appliquer la technique de la marche par blocs avec discrétisation DQ pour réduire le problème à un système d'équations algébriques linéaires.

La propagation des ondes thermiques à travers une plaque rectangulaire est régie par [15] :

(1)

et sont des paramètres de diffusion dans la direction x et y, respectivement.

a et b sont des dimensions de plaque dans la direction x et y, respectivement.

est une température maximale du système.

Le long des frontières externes, les températures peuvent être décrites comme :

(2a)

(2b)

(2c)

(2d)

sont des fonctions connues.

Alors la température initiale peut être décrite comme :

(3)

est une fonction connue.

La solution des équations (1)-(3) peut être obtenue comme suit :

(4a)

(4b)

(4c)

où N, M est le nombre de points de grille dans les directions x et y respectivement, L est le nombre de niveaux de temps dans le bloc et est la longueur du bloc dans le sens du temps.

(5)

soumis aux conditions aux limites et initiales prescrites dans les équations (2) et (3), en supposant

(6)

sont des fonctions inconnues et est un paramètre de perturbation.

La condition suivante est testée pour assurer la condition de convergence [20] dans la série précédente dans l'équation (6).

(7)

3) Sur la substitution durable de l'équation (6) en (5), on peut réduire le problème à l'équation suivante.

(8)

4) Application de la méthode de perturbation d'ordre zéro telle que,

(9)

(10a)

(10b)

(10c)

(10j)

(10e)

(10f)

où A et B sont respectivement les coefficients de pondération du premier et du second ordre.

Par substitution de l'équation (10) dans l'équation (9) résulter que,

(11)

5) La méthode de perturbation du premier ordre est appliquée de telle sorte que,

(12)

Soumis aux mêmes conditions aux limites et initiales n Equations (2), (3), réduites au système algébrique suivant

(13)

6) La méthode de perturbation du second ordre est également appliquée de telle sorte que,

(14)

Soumis aux mêmes conditions aux limites et initiales dans les équations (2), (3), réduites au système algébrique suivant

(15)

Enfin, la solution en série peut s'écrire sous la forme

(16)

Après avoir obtenu la solution dans le K ème bloc, nous passons au (K + 1) ème bloc où la solution au dernier niveau de temps au K ème bloc est considérée comme une condition initiale pour (K + 1) ème bloc. Nous poursuivons ce processus jusqu'à ce que l'heure spécifiée soit atteinte.

3. Résultats et discussions

Pour assurer la précision de la technique de marche par blocs proposée, le modèle de propagation des ondes thermiques est résolu à l'aide de la méthode présentée et comparé à la solution analytique disponible [15,21] et également comparé à la technique hybride de la méthode de quadrature différentielle et du quatrième ordre de Runge-Kutta méthode [15].

3.1. Résultats pour Onde thermique à une dimension

.

(17)

La solution exacte pour un tel problème peut être obtenue comme [21] :

(18)

(19a)

(19b)

(19c)

où P est le nombre de pas de temps dans le cas de l'utilisation de la méthode de Runge-Kutta et est considéré comme le nombre de blocs multiplié par le nombre de niveaux de temps dans le cas de la technique de marche par blocs.

Pour le calcul numérique, le domaine temporel est limité à et N = 7 tandis que et L ne sont pas fixes. L'efficacité de la technique de marche par blocs est testée par le temps CPU requis lorsque le calcul atteint t = 20 s. La condition de convergence dans l'équation (7) est également testée pour obtenir une plus grande précision avec la méthode de perturbation du second ordre, comme le montre la figure 1.

Le tableau 1 montre les erreurs R.M.S ˂ 7 × 10 𕒺 , les erreurs R.S.S ˂ 2 × 10 𕒸 et le temps CPU requis est de 0,132531 s.

La précision est très élevée en utilisant δt = 0,5 et L = 4 donc le nombre de blocs utilisés dans l'intervalle de temps sont 40 blocs.

A partir du tableau 2, on augmente à 1,00 et les niveaux de temps L à 10, les erreurs sont approximativement les mêmes mais le temps CPU est légèrement réduit à 0,118479 s et on n'utilise que 20 blocs.

À partir du tableau 3, nous augmentons δt à 2,00 et les niveaux de temps L à 15, la précision des résultats numériques peut être conservée la même que les cas précédents de δt = 0,5 et 1,00 mais le temps CPU est augmenté à 0,129549 s lorsque L

Figure 1 . Conditions de convergence satisfaisantes.

Tableau 1 . R.M.S, erreurs R.S.S, pas de temps et temps CPU par la méthode actuelle pour δt = 0,5 et L = 4.

Tableau 2 . R.M.S, erreurs R.S.S, pas de temps et temps CPU par méthode actuelle pour δt = 1,00 et L = 10.

Tableau 3 . R.M.S, erreurs R.S.S, pas de temps et temps CPU par méthode actuelle pour δt = 2,00 et L = 15.

Tableau 4 R.M.S, erreurs R.S.S, pas de temps et temps CPU par méthode actuelle pour δt = 2,00 et L = 10.

le nombre d'inconnues dans chaque bloc pour ce cas est beaucoup plus grand que les cas précédents présentés dans les tableaux 1 et 2. De plus, il peut être montré à partir du tableau 4, lorsque le nombre de niveaux de temps fixé à 10 la précision est restée la même que dans les cas précédents mais l'efficacité est d'autant plus améliorée que le temps CPU est réduit à 0,108360 s.

De plus, la figure 2 montre qu'à x = 0,25 et 0,75 l'erreur absolue à différents et moi.

La figure 3 montre que les effets de et L sur l'erreur absolue où augmente la précision augmentera et avec un choix approprié de L augmentera également l'efficacité. Si δt est trop grand, la précision des résultats numériques peut être considérablement réduite si L n'est pas assez grand. Dans tous les cas précédents, la condition de convergence de l'équation (15) est satisfaite.

Pour montrer la supériorité de la méthode de marche par blocs, la méthode RK4, qui est une approche de marche par couche, est également appliquée pour résoudre le même problème. Deux tailles de pas de temps de 0,001 et 0,005 sont utilisées pour le défilement des couches dans le sens du temps. Les résultats numériques de ces deux cas sont répertoriés respectivement dans les tableaux 5 et 6. A partir de ces deux tableaux, on peut voir que la méthode RK4 peut atteindre une précision élevée à une très petite taille de pas Dt = 0,001 avec et à Dt = 0,005 avec . De plus, comme le montre la figure 4, lorsque Dt augmente légèrement jusqu'à 0,00515, la condition de stabilité ne sera pas atteinte et l'oscillation se produira dans la période. D'autre part, l'efficacité est très faible car le temps CPU nécessaire pour atteindre t = 20 s est beaucoup plus important.

La figure 5 montre que la distribution de la température à différents moments et emplacements pour une solution numérique utilisant la technique de marche par blocs par rapport à la solution exacte et à la méthode RK4.

3.2. Résultats pour l'onde thermique à deux dimensions

Considérons aussi un simple problème à deux dimensions avec

Ce qui peut être résolu exactement comme [22,23] :.

La conception du schéma numérique est étendue à deux dimensions. Le tableau 7 montre que pour les résultats obtenus concordent avec les analytiques [21] avec et la précision de la marche en bloc est supérieure à celle de la méthode hybride.

La figure 6 montre cette erreur absolue pour la méthode présentée 𕒺 et l'erreur absolue 𕒸 mais si nous diminuons dt = 0,15 en utilisant deux blocs, l'erreur RMS = 1,3382 × 10 𕒸 et l'erreur absolue 𕒸 , le nombre de niveaux de temps ne n'affecte pas la précision de la solution.

La technique de marche par blocs avec discrétisation DQ est utilisée pour résoudre les propagations d'ondes thermiques en une et deux dimensions. Les résultats numériques sont obtenus bloc par bloc dans le sens du temps. Chaque bloc a plusieurs niveaux de temps. La longueur du bloc dans le sens du temps et le nombre de niveaux de temps L peut être ajusté pour conserver une précision et une efficacité élevées. La validité de la technique proposée est prouvée en comparant les résultats obtenus avec les précédents analytiques. La technique proposée nécessite un petit nombre de points de grille et un peu de com

Figure 2 . Erreur absolue à différents moments et emplacements.

Figure 3 . Comportement de l'erreur absolue avec le changement de δt et L.

Tableau 5 . Erreurs R.M.S, R.S.S, pas de temps et temps CPU donnés par Runge-Kutta à 4 étages à Δt = 0,001.

Tableau 6 . R.M.S, erreurs R.S.S, pas de temps et temps CPU donnés par Runge-Kutta en 4 étapes à Δt = 0,005.

Figure 4 . Erreurs absolues à différents moments et emplacements.

Figure 5 . Distributions de température à différents moments et endroits.

Graphique 6 . Erreur absolue à t = 0,1 s et différents emplacements de x, y.

Tableau 7 . Racine quadratique moyenne des erreurs pour la propagation bidimensionnelle des ondes thermiques à Δt = 0,01, N = 5, M = 4, L = 4, t = 0,01.

Graphique 7 . L'effet de t sur l'erreur absolue.

effort de calcul pour obtenir des résultats précis avec une erreur absolue. De plus, les résultats obtenus sont également comparés et en accord avec les résultats de la méthode RK4.


13.6 : Systèmes de réaction-diffusion

                                                              • Les virus en tant que systèmes adaptatifs complexes
                                                                Ricard Solé et Santiago Elena
                                                                SFI Primers in Complex Systems, Princeton U. Press, à paraître en décembre 2018
                                                              • L'architecture des réseaux mutualistes comme écoinçon évolutif
                                                                Sergi Valverde, Jordi Piñero, Bernat Corominas-Murtra, José M Montoya, Lucas Joppa et Ricard Solé
                                                                Nature Écologie et évolution 2 (1), 94.
                                                              • Coopération dans un monde ARN
                                                                Ricard Solé
                                                                Nature Écologie et évolution 2, doi: 10.1038/s41559-018-0649-5
                                                              • L'approche par ultrasons suit les microbes intestinaux
                                                                Ricard Solé et Nuria Condé-Pueyo
                                                                Nature 553, 36-37
                                                              • La voie de la multicellularité synthétique
                                                                Ricard Solé, Aina Ollé-Vila, Blai Vidiella, Salva Duran Nebreda et Nuria Conde-Pueyo
                                                                Opinion actuelle en biologie des systèmes 7, 60-67
                                                              • Théorie de l'information, prévisibilité et émergence de la vie complexe
                                                                Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                Science ouverte de la Royal Society,5 : 172221
                                                              • Le morphoespace des réseaux linguistiques
                                                                Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                Rapports scientifiques 8:10465
                                                              • Loi de Zipf, complexité illimitée et évolution ouverte
                                                                Bernat Corominas-Murtra, Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                Interface de la société royale, https://arxiv.org/abs/1612.01605
                                                              • Exploiter les transitions retardées pour soutenir les écosystèmes semi-arides après des changements catastrophiques
                                                                Blai Vidiella, Josep Sardanyés et Ricard Solé
                                                                Journal de la Royal Society Interface 15 : 20180083
                                                              • Dynamique de population des motifs synthétiques de terraformation
                                                                Ricard Solé, Raul Montañez, Salvador Duran, Daniel Rodriguez-Amor, Blai Vidiella, Josep Sardanyés
                                                                Royal Society Open Science 5: 180121
                                                              • Dynamique adaptative des populations cancéreuses instables : l'équation canonique
                                                                Guim Aguadé et Ricard Solé
                                                                Applications évolutives, 2018 1-10
                                                              • Bornes entropiques hors d'équilibre pour les réplicateurs darwiniens
                                                                Jordi Piñero et Ricard Solé
                                                                Entropie, 20(2), 98
                                                              • Un modèle d'évolution spatio-temporel simple d'un réseau électrique de transport
                                                                Marti Rosas-Casals, Sergi Valverde et Ricard Solé
                                                                Journal des systèmes IEEE
                                                                                                                            • La biotechnologie microbienne comme outil pour restaurer les terres arides dégradées
                                                                                                                              Fernando Maestre, Ricard Solé et Brajesh K. Singh
                                                                                                                              Biotechnologie microbienne, DOI : 10.1111/1751-7915.12832
                                                                                                                            • Apprentissage associatif synthétique dans les consortiums multicellulaires d'ingénierie
                                                                                                                              Javier Macia, Blai Vidiella et Ricard Solé
                                                                                                                              Journal Royal Society Interface 14, 20170158
                                                                                                                            • Systèmes prêts à la criticité grâce aux forces sélectives de Pareto
                                                                                                                              Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                                                                              Soumis, https://arxiv.org/abs/1510.08697
                                                                                                                            • L'architecture des réseaux mutualistes comme écoinçon évolutif
                                                                                                                              Sergi Valverde, José M Montoya, Lucas Joppa et Ricard Solé
                                                                                                                              Écologie et évolution de la nature, acceptée, https://arxiv.org/abs/1612.01606
                                                                                                                            • Transitions abruptes vers l'extinction des tumeurs : un modèle phénotypique quasi-spécifique
                                                                                                                              Josep Sardanyés, Regina Martinez, Carles Simó et Ricard Solé
                                                                                                                              J. Maths. Biol. 74(7), 1589-1609
                                                                                                                            • Analyse complète des petits hypercycles avec courts-circuits dans l'évolution prébiotique
                                                                                                                              J Sardanyés, JT Lazaro, T Guillamon et E Fontich
                                                                                                                              Physique D 347, 90-108
                                                                                                                                                                                          • De retour du bord
                                                                                                                                                                                            Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Nouveau scientifique 232, 36-37
                                                                                                                                                                                          • La bioremédiation à l'échelle mondiale : de l'éprouvette à la planète Terre
                                                                                                                                                                                            Victor de Lorenzo, Philippe Marlière et Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Biotechnologie microbienne 9, 618-625.Microbe. Biotechnologies.
                                                                                                                                                                                          • Auto-organisation spatiale dans des modèles hybrides d'adhésion multicellulaire
                                                                                                                                                                                            Adriano Bonforti, Salva Duran-Nebreda, Raul Montañez et Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Chaos 26, 103113
                                                                                                                                                                                          • La logique de los monstruos
                                                                                                                                                                                            Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Tusquets Métatema
                                                                                                                                                                                          • Les transitions synthétiques majeures de l'évolution
                                                                                                                                                                                            Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Phil. Trans. Soc Royale. B 371 (1701), 20160175
                                                                                                                                                                                          • Transitions synthétiques : vers une nouvelle synthèse
                                                                                                                                                                                            Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Phil. Trans. Soc Royale. B 371 (1701), 20150438
                                                                                                                                                                                          • Optimisation multi-objectifs et transitions de phase
                                                                                                                                                                                            Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Springer Proceedings in Complexity, pp 259-270.
                                                                                                                                                                                          • Hacia una bioingenieria del planeta
                                                                                                                                                                                            Ricard Solé, Raul Montañez et Salva Duran-Nebreda
                                                                                                                                                                                            Investigación y Ciencia, juin 2016
                                                                                                                                                                                          • Théorie des champs des coopérateurs moléculaires
                                                                                                                                                                                            J. Piñero et R. Solé
                                                                                                                                                                                            Soumis, arXiv préimpression arXiv:1508.01422v1
                                                                                                                                                                                          • Principes de conception des orgues et organoïdes synthétiques : le possible et le réel
                                                                                                                                                                                            Aina Ollé-Vila, Salva Duran-Nebreda, Nuria Conde-Pueyo, Raul Montañez et R. Solé
                                                                                                                                                                                            Biologie intégrative 8, 485 - 503
                                                                                                                                                                                          • Prédiction de la stabilité des duplications de gènes homologues dans un virus à ARN végétal
                                                                                                                                                                                            A Willemsen, MP Zwart, P Higueras, J Sardanyés et SF Elena
                                                                                                                                                                                            Biologie et évolution du génome 8 (9), 3065-3082
                                                                                                                                                                                          • Un modèle de diffusion culturelle pour l'essor et la chute des langages de programmation
                                                                                                                                                                                            S Valverde et R Solé
                                                                                                                                                                                            Biologie humaine 87, 224-234
                                                                                                                                                                                          • Vers des modèles spatiaux synthétiques dans les populations de cellules modifiées avec chimiotaxie
                                                                                                                                                                                            S Duran-Nebreda et R Solé
                                                                                                                                                                                            Biologie synthétique ACS, 5, 654-661
                                                                                                                                                                                          • Un dispositif de mémoire multicellulaire synthétique
                                                                                                                                                                                            A. Urrios, J. Macia, R. Manzoni, N. Conde, L. deNadal, F. Posas et R Solé
                                                                                                                                                                                            Biologie synthétique ACS, 5, 862-873.
                                                                                                                                                                                          • Emergence de proto-organismes issus de la différenciation et de l'adhésion stochastiques bistables
                                                                                                                                                                                            S Duran-Nebreda, A Bonforti, R Montañez, S Valverde et R Solé
                                                                                                                                                                                            J. Interface de la Société royale, 13, 20160108.
                                                                                                                                                                                          • Mise en œuvre de circuits logiques biologiques complexes utilisant des consortiums multicellulaires spatialement distribués
                                                                                                                                                                                            J. Macía, R. Manzoni, N. Conde, L. de Nadal, R. Solé, F. Posas
                                                                                                                                                                                            Biologie computationnelle PLOS 12(2) : e1004685
                                                                                                                                                                                          • Sur les singularités et les trous noirs dans les modèles combinatoires des réseaux d'innovation technologique
                                                                                                                                                                                            Ricard V. Solé, Daniel R. Amor, Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                            PLOS UN 11(1) : e0146180
                                                                                                                                                                                          • Transitions majeures dans les technologies de l'information
                                                                                                                                                                                            Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                            Phil. Trans. Soc Royale. B 371 (1701), 20150450
                                                                                                                                                                                          • Intelligence collective synthétique
                                                                                                                                                                                            R Sole, DR Amor, S Duran-Nebreda, N Conde, M Carbonell et R Montañez
                                                                                                                                                                                            Biosystèmes 148, 47-61.
                                                                                                                                                                                          • Conceptions de circuits synthétiques pour la terraformation terrestre
                                                                                                                                                                                            R Sole, R. Montañez et S. Duran-Nebreda
                                                                                                                                                                                            Biologie Direct 10:37.
                                                                                                                                                                                          • Implémentation informatique d'un circuit de mémoire multicellulaire accordable pour des consortiums eucaryotes modifiés
                                                                                                                                                                                            J. Sardanyés, A. Bonforti, N. Conde, R. Solé et J. Macía
                                                                                                                                                                                            Frontières en physiologie 6 : 281
                                                                                                                                                                                          • Analyse des bifurcations des hypercycles oscillants
                                                                                                                                                                                            A. Guillamon, E. Fontich et J. Sardanyés
                                                                                                                                                                                            Journal de biologie théorique 387 : 23
                                                                                                                                                                                          • Criticalidad en redes biológicas
                                                                                                                                                                                            S Valverde et J. Garcia-Ojalvo
                                                                                                                                                                                            Recherche et Science
                                                                                                                                                                                          • Images de l'esprit : évolution de l'image BCI basée sur une présentation visuelle en série rapide de primitives de polygones
                                                                                                                                                                                            Luís F. Seoane, Stephan Gabler et Benjamin Blankertz
                                                                                                                                                                                            Interfaces cerveau-ordinateur, en version imprimée (2015).
                                                                                                                                                                                          • Comportement chimique émergent dans les protocellules à volume variable
                                                                                                                                                                                            Ben Shirt-Ediss, Ricard Solé et Kepa Ruiz-Mirazo
                                                                                                                                                                                            Vie 5(1), 181-211
                                                                                                                                                                                          • Émergence de la multicellularité dans un modèle de croissance, de mort et d'agrégation cellulaire sous sélection dépendante de la taille
                                                                                                                                                                                            Salva Duran-Nebreda et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                            Interface de la société royale 12 : 20140982
                                                                                                                                                                                          • Dynamique et bifurcations dans un modèle quasi-spécifique simple de tumorigenèse
                                                                                                                                                                                            V. Castillo, J.T. Lázaro et J. Sardanyés
                                                                                                                                                                                            Mathématiques computationnelles et appliquées, en prépublication pressarXiv : 1411.6531
                                                                                                                                                                                          • Quelle est la complexité, la probabilité et la prévisibilité du chaos génétique de la Reine Rouge ?
                                                                                                                                                                                            J. Duarte, C. Rodrigues, C. Januário, N. Martins et J. Sardanyés
                                                                                                                                                                                            Acta Biotheoretica, 63 : 341
                                                                                                                                                                                          • Transitions de phase dans les réseaux optimaux de Pareto
                                                                                                                                                                                            Luis Seoane et Ricard Solé
                                                                                                                                                                                            Examen physique E, 92 : 032807
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Une caractérisation ascendante des fonctions de transfert pour les conceptions de biologie synthétique : leçons de l'enzymologie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Max Carbonell, Salva Duran-Nebreda, Raul Montañez, Ricard Solé, Javier Macia et Carlos Rodríguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Recherche sur les acides nucléiques, 42 (22), 14060-14069
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Changements catastrophiques et seuils létaux dans un modèle de front se propageant de progression tumorale instable
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Daniel R. Amor et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Examen physique E 90, 022710
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Modèle de réaction-diffusion de cohabitation pour les infections focales virales
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Daniel R. Amor et Fort Joaquim
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Physica A 416, 611-619
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Modes de réplication de l'ARN viral : implications évolutives et dynamiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Josep Sardanyes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Tendances en Mathématiques 2, 115-119préimpression arXiv en ligne : 1404.0198
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Principes de conception des motifs formant des rayures: le rôle du feedback positif
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Andrea Munteanu, James Cotterell, Ricard V. Solé et James Sharpe
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Rapports scientifiques sur la nature, 4, 5003
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Évolution expérimentale d'un virus végétal émergent dans des génotypes d'hôtes qui diffèrent par leur sensibilité à l'infection
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Hillung, J., Cuevas, J.M., Valverde, S., Elena, S.F.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Doi d'évolution : 10.1111/evo.12458
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Comment faire un ordinateur multicellulaire synthétique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        PLoS un, 9(2), e81248
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • In silico transitions vers la multicellularité
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé et Salva Duran-Nebreda
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        arXiv préimpression arXiv:1403.3217
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Dans : Nedelcu, A.M. et Ruiz-Trillo, I. (éd.) (sous presse). Transitions évolutives vers la vie multicellulaire : principes et mécanismes. Springer-Verlag Londres
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Modélisation de la dynamique de compétition lipidique dans des populations de protocellules hétérogènes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ben Shirt-Ediss, Kepa Ruiz-Mirazo, Fabio Mavelli et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Rapports scientifiques sur la nature
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Morphoespaces en réseau
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Andrea A. Koenigsberger, Joaquin Goñi, Ricard Solé et Olaf Sporns
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Journal de la Royal Society Interface, 12 : 201408812
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Coévolution de la reine rouge sur les paysages de remise en forme
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé et Josep Sardanyés Dans : Avancées récentes dans la théorie et l'application des paysages de remise en forme. Springer-Verlag, p.301-38préimpression arXiv:1303.5633
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Biologie synthétique : Biocircuits en synchronie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé et Javier Macia
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Nature, 508(7496), 326-327
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Evolution spatio-temporelle d'un réseau de transport d'électricité
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Martí Rosas Casals, Sergi Valverde, Bernat Corominas-Murtra et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Examen physique E (soumis)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Vers une théorie mathématique de la communication significative
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Bernat Corominas-Murtra, Jordi Fortuny Andreu et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Rapports scientifiques sur la nature, 4, 4587
                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • La variabilité des effets de remise en forme mutationnelle empêche les transitions létales complètes dans les grandes populations de quasi-espèces
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Josep Sardanyés, Carles Simó, Regina Martínez, Ricard V. Solé et Santiago F. Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Rapports scientifiques sur la nature, 4, 4625
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Une approche d'optimisation multiobjectif de la mécanique statistique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Luís F. Seoane et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      arXiv préimpression arXiv:1310.6372
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Invasion tumorale accélérée sous dispersion cellulaire non isotrope dans les glioblastomes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Fort Joaquim et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Nouveau Journal de Physique, 15(5), 055001
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Une solution analytique d'un modèle de compétition linguistique avec bilinguisme et similarité interlinguistique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Victoria Otero-Espinar, Luís F. Seoane, Juan J. Nieto et Jorge Mira
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Physica D : Phénomènes non linéaires, 264, 17-26
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Avant les formes infinies : modèle incarné de transition des cellules individuelles aux agrégats et à l'ingénierie des écosystèmes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      PloS un, 8(4), e59664
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Dynamique complexe de baculovirus interférents défectueux lors de passages en série dans des cellules d'insectes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Mark P. Zwart, Gorben P. Piljman, Josep Sardanyés, Jorge Duarte, Cristina Januário et Santiago F. Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal de physique biologique, 39(2), 327-342
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Élargir le paysage du calcul biologique avec des consortiums multicellulaires synthétiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé et Javier Macia
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Informatique naturelle, 12(4), 485-497
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Les réseaux et la ville
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Conception architecturale, 83(4), 112-119
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • De l'origine de l'ambiguïté dans la communication efficace
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Jordi Fortuny et Bernat Corominas-Murtra
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal de la logique, du langage et de l'information, 22(3), 249-267
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Aux origines de la hiérarchie dans les réseaux complexes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Bernat Corominas-Murtra, Joaquin Goñi, Ricard V. Solé et Carlos Rodríguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Actes de l'Académie nationale des sciences, 110(33), 13316-13321
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Réseaux d'infection phage-bactérie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Joshua S. Weitz, Timothée Poisot, Justin R. Meyer, Cesar O. Flores, Sergi Valverde, Matthew B. Sullivan, Michael E. Hochberg
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Tendances en microbiologie, 21(2), 82-91
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Plasticité, évolutivité et abondance des boucles feed-forward dans les réseaux de transcription"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Stefanie Widder, Ricard V. Solé et Javier Macía
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Füllsack, Manfred (éd.) Réseaux de mise en réseau. Origines, Applications, Expériences. ISIS, p.81-100
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Conception de biocalcul synthétique utilisant des réseaux de régulation génétique supervisés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Luís F. Seoane et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      arXiv préimpression arXiv:1310.5017
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • L'écologie évolutive des innovations technologiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé, Sergi Valverde, Martí Rosas Casals, Stuart A. Kauffman, Doyne Farmer et Niles Eldredge
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Complexité 18(4), 15-27
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Complexité topologique et prévisibilité dans la dynamique d'un modèle de croissance tumorale avec le chaos de Shilnikov
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Jorge Duarte, Cristina Januário, Carla Rodrigues et Josep Sardanyés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal international de la bifurcation et du chaos, 23(07), 1350124-1350136
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • Réseaux complexes : structure, robustesse et fonction (critique de livre)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Journal de l'Association statistique américaine
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • Calcul distribué : la nouvelle vague de dispositifs biologiques synthétiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Javier Macía, Francesc Posas et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Tendances en biotechnologie, 30(6), 342-349
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • L'évolutivité de l'architecture de boucle feed-forward biaise son abondance dans les réseaux de transcription
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Stefanie Widder, Ricard V. Solé et Javier Macía
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            BMC Systems Biologie, 6(1), 7
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • Épistasie modulaire évoluée dans les organismes artificiels
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Sergi Valverde, Ricard V. Solé et Santiago Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Vie artificielle, 13, 111-115
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • "Motifs dans les graphiques"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Dans : Meyers, R.A. (éd.) Complexité informatique : théorie, techniques et applications. Springer-Verlag New York, p.1919-28
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • Structure multi-échelle et moteurs géographiques de l'infection croisée au sein des bactéries et des phages marins
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            César O. Flores, Sergi Valverde et Joshua S. Weitz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            La revue ISME, 7(3), 520.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • "Les transitions de phase dans le cancer"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Dans : d'Onofrio, A. et al. (éd.) Nouveaux défis pour la biomédecine des systèmes anticancéreux. Springer-Verlag. p.35-51
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          • Les causes de l'épistasie dans les réseaux génétiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Javier Macía, Ricard V. Solé et Santiago Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Évolution, 66(2), 586-596

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Nouvelles liées à ce livre:

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Analyse des pannes majeures du réseau électrique européen
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Marti Rosas Casals et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  International Journal of Electrical Power & Energy Systems, 33(3), 805-808
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • "Catastrophes et réseaux complexes dans la tumorigenèse génomiquement instable"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Dans : Deisboeck, T.S. & Stamatakos, G.S. (éd.) Modélisation multi-échelle du cancer. New York : Taylor & Francis Group, p.67-86.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Chemins évolutifs convergents dans les réseaux biologiques et technologiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé, Sergi Valverde et Carlos Rodriguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Évolution : Éducation et sensibilisation, 4(3), 415-426

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Ce document a été présenté dans

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • "Analyse des systèmes dynamiques d'un compartiment lipidique protocellulaire"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ben Chemise-Ediss
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Dans : Kampis, G. Karsaï, je. & Szathmáry,E. (éd.) Avancées de la vie artificielle. Darwin rencontre von Neumann. Springer-Verlag, p.230-9
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Emergence de la loi de Zipf dans l'évolution de la communication
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Bernat Corominas-Murtra, Jordi Fortuny et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Examen physique E, 83(3), 036115

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Cet article a été mis en évidence dans : Chaos

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • La modélisation de la régulation croisée des lymphocytes T effecteurs-régulateurs révèle le caractère intrinsèque des rechutes dans la sclérose en plaques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Nieves Vélez de Mendizábal, Jorge Carneiro, Ricard V. Solé, Joaquín Goñi, Jean Bragard, Ivan Martinez-Forero, Sara Martinez-Pasamar, Jorge Sepulcre, Javier Torrealdea, Francesca Bagnato, Jordi Garcia-Ojalvo et Pablo Villoslada
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  BMC Systems Biologie, 5(1), 114
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Transitions de phase
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  New Jersey : Princeton University Press (Série d'amorces de la complexité)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • L'organisation sémantique de la catégorie animale : évidence de la fluidité verbale sémantique et de la théorie des réseaux
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Joaquín Goñi, Gonzalo Arrondo, Jorge Sepulcre, Iñigo Martincorena, Nieves Vélez de Mendizábal, Bernat Corominas-Murtra, Bartolomé Bejarano, Sergio Ardanza-Trevijano, Herminia Peraita, Dennis P. Wall et Pablo Villoslada
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Traitement cognitif, 12(2), 183-196
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Éviter la compétition des facteurs de transcription au niveau du promoteur augmente les chances d'obtenir une oscillation
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Andreea Munteanu, Marco Constante, Mark Isalan et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        BMC Systems Biologie, 4(1), 66
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • "Discerner les modèles de consommation d'électricité à partir de la mise à l'échelle allométrique urbaine"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard Horta-Bernus, M. Rosas-Casals et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Dans: Complexité en ingénierie, 2010. COMPENG'10. IEEE, p.49-51
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Diversité, compétition, extinction : l'écophysique du changement de langue
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé, Bernat Corominas-Murtra et Jordi Fortuny
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Journal de l'interface de la Royal Society, 7(53), 1647-1664
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • « L'émergence de réseaux de syntaxe sans échelle »
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Bernat Corominas-Murtra, Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Dans : Nolfi, S. & Mirolli, M. (éd.) Évolution de la communication et du langage chez les agents incarnés. Springer-Verlag Berlin, p.83-101
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Explorer le caractère aléatoire des réseaux acycliques dirigés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Joaquín Goñi, Bernat Corominas-Murtra, Ricard V. Solé et Carlos Rodriguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Examen physique E, 82(6), 066115
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Taille du génome, auto-organisation et matière noire de l'ADN
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Complexité, 16(1), 20-23
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Hiérarchie et informations dans les réseaux feedforward
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Bernat Corominas-Murtra, Joaquín Goñi, Carlos Rodriguez-Caso et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Document de travail de l'Institut de Santa Fe, 10-12-036
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Réseaux linguistiques : leur structure, leur fonction et leur évolution
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé, Bernat Corominas-Murtra, Sergi Valverde et Luc Steels
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Complexité, 15(6), 20-26
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Sur l'imbrication dans les réseaux écologiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Lucas Joppa, José Mª Montoya, Ricard V. Solé, James Sanderson et Stuart Pimm
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Recherche en écologie évolutive, 12(1), 35-46
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Percolation de sous-graphes imbriqués non corrélés arbitraires
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Bernat Corominas-Murtra
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Le Journal Physique Européen B, 77(2), 213-217
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Modèle simple de dynamique de récupération après extinction de masse
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ricard V. Solé, Joan Saldanya, José Mª Montoya et Douglas H. Erwin
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Journal de biologie théorique, 267(2), 193-200
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Quelques considérations formelles sur la génération d'expressions structurées hiérarchiquement
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Jordi Fortuny Andreu et Bernat Corominas-Murtra
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Revue Catalane de Linguistique, 8, 99-111
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Switcher-random-walks : un mécanisme d'inspiration cognitive pour l'exploration des réseaux
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Joaquín Goñi, Iñigo Martincorena, Bernat Corominas-Murtra, Gonzalo Arrondo, Sergio Ardanza-Trevijano et Pablo Villoslada
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Journal international des bifurcations et du chaos, 20(3), 913-922
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Universalité de la loi de Zipf
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Bernat Corominas-Murtra et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Examen physique E, 82(1), 011102
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      • Quand le métabolisme rencontre la topologie : Réconcilier les réseaux de métabolites et de réactions
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Raúl Montañez, Miguel Angel Medina, Ricard V. Solé et Carlos Rodríguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Essais biologiques, 32(3), 246-256
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Robustesse distribuée dans les réseaux cellulaires : aperçu des circuits synthétiques évolués
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Journal de l'interface de la Royal Society, 6(33), 393-400
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Rôle dynamique du degré de coopération intraspécifique : un modèle simple pour les réplicateurs prébiotiques et les écosystèmes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Ernest Fontich et Josep Sardanyés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Physica A : la mécanique statistique et ses applications, 388(9), 1867-1878
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Réseaux écologiques – au-delà des réseaux trophiques (Examen)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Thomas C. Ings, José M. Montoya, Jordi Bascompte et al.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Journal d'écologie animale, 78(1), 253-269
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Evolution et auto-assemblage de protocellules
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 41(2), 274-284
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Fantômes dans les systèmes dynamiques non linéaires de grande dimension : l'exemple du hypercycle
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Josep Sardanyes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Chaos, solitons et fractales, 39(1), 92-100
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Inférence létale synthétique humaine en tant que détection potentielle de gènes cibles anticancéreux
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Nuria Conde-Pueyo, Andreea Munteanu, Ricard V. Solé et Carlos Rodriguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              BMC Systems Biologie, 3(1), 116
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Bistabilité monomère et rôle des boucles automatiques dans la régulation des gènes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Stefanie Widder, Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              PloS un, 4(4), e5399
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • "Motifs dans les graphiques"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Dans : Meyers, Robert A. (éd.) Encyclopédie de la complexité et de la science des systèmes. Springer-Verlag New York, p.5692-702
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Muter maintenant, mourir plus tard. Dynamique évolutive avec sélection retardée
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Andreea Munteanu et Peter F. Stadler
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Journal de biologie théorique, 260(3), 412-421

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Cet article est à la couverture de : Systems Biology Special Issue

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Perturbations de la presse et effets indirects dans les réseaux trophiques réels
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              José Mª Montoya, Guy Woodward, Mark Emmerson et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Écologie, 90(9), 2426-2433
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Spécialisation réciproque en réseaux écologiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Lucas N. Joppa, Jordi Bascompte, José Mª Montoya, Ricard V. Solé, Jim Sanderson et Stuart L. Pimm
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Lettres d'écologie, 12(9), 961-969
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Le mode de réplication et la topologie du paysage affectent différemment la charge mutationnelle et la robustesse du virus à ARN
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Josep Sardanyés, Ricard V. Solé et Santiago Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Journal de virologie, 83(23), 12579-12589
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • Motifs de boucle feed-forward spécialisés ou flexibles : une question de topologie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              BMC Systems Biologie, 3(1), 84
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • "L'hypercycle : de la dynamique moléculaire à la dynamique des écosystèmes"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Josep Sardanyes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Dans : Dupont, A. & Jacobs, H. (éd.) Tendances de la recherche en écologie du paysage. New York : Nova Science Publishers, Inc., p.113-24
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            • L'ontogenèse des réseaux de syntaxe sans échelle : transitions de phase dans l'acquisition précoce du langage
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Bernat Corominas-Murtra, Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Avancées dans les systèmes complexes, 12(03), 371-392

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Cet article a été présenté dans : Faculty of 1000 Biology

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Les cellules souches cancéreuses comme moteur d'une progression tumorale instable
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé, Carlos Rodríguez-Caso, Thomas S. Deisboeck et Joan Saldanya
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal de biologie théorique, 253(4), 629-637
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Intégralité des données : le talon d'Achille des réseaux cibles de médicaments
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Jordi Mestres, Elisabet Gregori-Puigjané, Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Biotechnologie naturelle, 26, 983-984
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Fantômes de seuil d'erreur dans un hypercycle simple avec auto-réplication sujette aux erreurs
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Josep Sardanyes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Chaos, solitons et fractales, 35(2), 313-319
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Queues grasses, mémoire longue, maturité et vieillissement dans les projets de logiciels open source
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Damien Challet et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      arXiv préimpression arXiv:0802.3170
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      PHYSCOMNET 2008 : <http://www.physcomnet.org/>
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Loi d'échelle générale dans la bifurcation nœud-selle : une étude complexe de l'espace des phases
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ernest Fontich et Josep Sardanyés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal of Physics A : mathématique et théorique, 41(1), 015102
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Modèles macroécologiques et structure de niche dans un nouveau réseau trophique marin
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Gabriel Yvon-Durocher, José Mª Montoya, Mark C. Emmerson et Guy Woodward
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Revue de biologie d'Europe centrale, 3(1), 91-103
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Correspondance de la dynamique des allèles et de la coévolution dans un modèle minimal de réplicateur prédateur-proie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Lettres de physique A, 372(4), 341-350
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Modèles de réplication de protocellules"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé, Javier Macía, Harold Fellermann, Andreea Munteanu, Josep Sardanyés et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Rasmussen, S. et al. (éd.) Protocells : faire le pont entre la matière non vivante et la matière vivante. Bourse de presse du MIT en ligne, p.213-31
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Sous-graphes imbriqués de réseaux complexes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Bernat Corominas-Murtra, José F. F. Mendes et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal of Physics A : mathématique et théorique, 41(38), 385003
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Neutralité et robustesse en Evo-Devo : émergence de l'inhibition latérale
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Andreea Munteanu et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Biologie computationnelle PLoS, 4(11), e1000226
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Sur les réseaux et les monstres : le possible et l'actuel dans les systèmes complexes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Léonard (MIT Press), 41(3), 253-258
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Robustesse des réseaux électriques européens sous attaque intentionnelle
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé, Martí Rosas Casals, Bernat Corominas-Murtra et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Examen physique E, 77(2), 026102
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Modèles de quasi-espèces simples pour l'effet Survie du plus plat : le rôle de l'espace
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Josep Sardanyés, Santiago F. Elena et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal de biologie théorique, 250(3), 560-568
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Superdiffusion et taux de rencontre dans des mondes dilués et de faible dimension
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Fede Bartumeus, Pau Fernández, M. G. E. da Luz, Jordi Catalan, Ricard V. Solé et Simon A. Levin
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Thèmes spéciaux du European Physical Journal, 157(1), 157-166
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "La forteresse topologique des termites"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Andrea Perna, Christian Jost, Sergi Valverde, Jacques Gautrais, Guy Theraulaz et Pascale Kuntz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Liò, P. et al. (éd.) Informatique et communication bio-inspirées. Springer Berlin Heidelberg, p.165-73
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Analyse topologique des réseaux cellulaires"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Carlos Rodríguez-Caso et Núria Conde-Pueyo
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Giannopoulou, E. G. (éd.) L'exploration de données dans la recherche médicale et biologique. Éditeurs Intech, p.253-66
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Efficacité topologique dans les réseaux tridimensionnels de galeries de termitières
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Andrea Perna, Sergi Valverde, Jacques Gautrais, Christian Jost, Ricard V. Solé, Pascale Kuntz et Guy Theraulaz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Physica A : la mécanique statistique et ses applications, 387(24), 6235-6244
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Stabilité chaotique dans les réplicateurs hôtes-parasites à résolution spatiale : la reine rouge sur un réseau
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Journal international des bifurcations et du chaos, 17(2), 589-606
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Croisement de l'activité endogène à l'activité exogène dans le développement de logiciels open source
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Lettres Europhysiques, 77(2), 20002
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Transitions retardées dans les réseaux de réplicateurs non linéaires : à propos des fantômes et des hypercycles
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Chaos, solitons et fractales, 31(2), 305-315
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Réseaux écologiques : la théorie de l'information rencontre la banque enchevêtrée de Darwin
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                José Mª Montoya et Gabriel Yvon-Durocher
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Biologie actuelle, 17(4), R128-R130
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Écologie : lois d'échelle dans le séchoir
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Nature, 449(7159), 151-153
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Études évolutionnistes : Évolution au sein des réseaux trophiques : le possible et le réel
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                José Mª Montoya
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Hérédité, 99, 477-478
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Sélection darwinienne générique dans les assemblages de protocellules catalytiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Andreea Munteanu, Camille Stephan-Otto Attolini, Steen Rasmussen, Hans-Joachim Ziock et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Transactions philosophiques de la Royal Society B : Sciences biologiques, 362(1486), 1847-1855
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Petits mondes hiérarchiques en architecture logicielle
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                arXiv préimpression arXiv:0307278v2
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Dynamique des systèmes continus discrets et impulsifs. Série B : Applications et algorithmes, numéro spécial <http://www.watsci.org/B/index.html>
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Sous-graphes K-scaffold de réseaux complexes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Bernat Corominas-Murtra, Sergi Valverde, Carlos Rodríguez-Caso et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Lettres Europhysiques, 77(1), 18004
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Cycle de vie d'une protocellule minimale : une étude de la dynamique dissipative des particules
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Harold Fellermann, Steen Rasmussen, Hans-Joachim Ziock et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Vie artificielle, 13(4), 319-345
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Modèle minimal de nanocellules auto-réplicables : un scénario sans information physiquement incorporé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Harold Fellermann et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Transactions philosophiques de la Royal Society B : Sciences biologiques, 362(1486), 1803-1811
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • "Modularité dans les réseaux biologiques"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Ricard V. Solé, Sergi Valverde et Carlos Rodríguez-Caso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Dans : Képès, F. (éd.) Réseaux biologiques. World Scientific Publishing (Systèmes complexes et science interdisciplinaire, 3), p.21-40
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Statistiques du réseau sur la syntaxe anglaise ancienne : critères structurels
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Bernat Corominas-Murtra
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                arXiv préimpression arXiv:0704.3708
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Paysages de fitness neutres dans les réseaux de signalisation
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Pau Fernández et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Journal de l'interface de la Royal Society, 4(12), 41-47
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Auto-reproduction de protocellules dans un système métabolisme-vésicule étendu dans l'espace
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Journal de biologie théorique, 245(3), 400-410
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • reine Rouge attracteurs étranges dans la coévolution gène pour gène du réplicateur hôte-parasite
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Chaos, solitons et fractales, 32(5), 1666-1678
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Dynamique spatio-temporelle dans les hypercycles asymétriques simples sous couplage parasite faible
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Physica D : Phénomènes non linéaires, 231(2), 116-129
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Biologie des protocellules synthétiques : de la reproduction au calcul
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Ricard V.Solé, Andreea Munteanu, Carlos Rodríguez-Caso et Javier Macía
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Transactions philosophiques de la Royal Society B : Sciences biologiques, 362(1486), 1727-1739
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Protocellules de Turing synthétiques : auto-reproduction des vésicules par instabilités de rupture de symétrie
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Javier Macia et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Transactions philosophiques de la Royal Society B : Sciences biologiques, 362(1486), 1821-1829
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Le rôle de la coopération et des parasites dans les extinctions retardées des réplicateurs non linéaires
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Chaos, solitons et fractales, 31(5), 1279-1296
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              • Vulnérabilité topologique du réseau électrique européen en cas d'erreurs et d'attaques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Martí Rosas-Casals, Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Journal international des bifurcations et du chaos, 17(7), 2465-2475
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Les motifs de réseau sont-ils les écoinçons de la complexité cellulaire ?
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Ricard V. Solé et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Tendances de l'écologie et de l'évolution, 21(8), 419-422
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Bifurcations et transitions de phase dans les hypercycles à deux membres spatialement étendus
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal de biologie théorique, 243(4), 468-482
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • « La fusion du réseau écologique due à la perte et à la fragmentation de l'habitat »
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Ricard V. Solé et José Mª Montoya
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Dans : Pascual, M. & Dunne, J.A. (eds.) Réseaux écologiques. Lier la structure à la dynamique dans les réseaux alimentaires. Université d'Oxford. Presse, p.325-47

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Ce document a été présenté dans :

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Des fantômes aux origines de la vie ?
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Josep Sardanyés et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal international des bifurcations et du chaos, 16(09), 2761-2765
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Catastrophe informationnelle dans les virus à ARN par les seuils de réplication
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Ricard V. Solé, Josep Sardanyés, Juana Díez et Antonio Mas
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal de biologie théorique, 240(3), 353-359
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Topologie du réseau et auto-cohérence dans les jeux de langage
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Bernat Corominas-Murtra et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal de biologie théorique, 241(2), 438-441
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • "Sur la nature du design"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Dans : Braha, D. Minai, A. A. & Bar-Yam, Y. (éd.) Systèmes d'ingénierie complexes. Springer, p.72-100
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Formation de motifs dans les endroits bruyants qui se reproduisent
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Andreea Munteanu et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal international des bifurcations et du chaos, 16(12), 3679-3685
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Diversité phénotypique et chaos dans un modèle cellulaire minimal
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Andreea Munteanu et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Journal de biologie théorique, 240(3), 434-442

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Notre livre a été présenté dans :

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Modèles d'auto-organisation dans les communautés de guêpes et open source
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Sergi Valverde, Guy Theraulaz, Jacques Gautrais, Vincent Fourcassié et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Systèmes intelligents, IEEE, 21(2), 36-40
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • "Dynamique spatiale dans le cancer"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Ricard V. Solé, Isabel González-García et Josep Costa
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Dans : Deisboeck, T.S. & Kresh, J.Y. (éd.) Systèmes complexes en biomédecine. Springer Inc., p. 557-572
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Le plus apte contre le plus plat : confirmation expérimentale de l'effet de quasi-espèce avec des agents pathogènes subviraux
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Francisco Codoñer, José Daròs, Ricard V. Solé et Santiago Elena
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Pathogènes PLoS, 2(12), e136
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • "Le rôle du calcul dans les réseaux réglementaires complexes"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Pau Fernández et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Dans : Koonin, E.V. et al. (éd.) Lois de puissance, réseaux sans échelle et biologie du génome. Urekah.com et Springer Science, p.206-25
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        • Modèles topologiques dans les réseaux de rues des établissements urbains auto-organisés
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Jérôme Buhl, Jacques Gautrais, Reeves Nicolas, Ricard V. Solé, Sergi Valverde, Pascale Kuntz et Guy Theraulaz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          The European Physical Journal B - Matière condensée et systèmes complexes, 49(4), 513-522
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Perte de biodiversité et structure du réseau écologique"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Jane Memmott, David Alonso, Eric L. Berlow, Andy Dobson, Jennifer A. Dunne, Ricard V. Solé et Joshua Weitz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Pascual, M. & Dunne, J.A. (eds.) Réseaux écologiques. Lier la structure à la dynamique dans les réseaux alimentaires. Université d'Oxford. Presse, p.325-47
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • La taille du corps dans les réseaux écologiques
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Guy Woodward, Bo Ebenman, Mark Emmerson, José Mª Montoya, Jens M. Olesen, Alfredo Valido et Philip H. Warren
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Tendances de l'écologie et de l'évolution, 20(7), 402-409
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Taille du corps, force d'interaction et dynamique du réseau trophique"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Mark C. Emmerson, José Mª Montoya et Guy Woodward
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : De Ruiter, P.C. Wolters, V. & Moore, J.C. (eds) Réseaux trophiques dynamiques. Presse académique, p.167-78
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • « Déterminants de la taille corporelle de la structure et de la dynamique des réseaux écologiques : l'échelle de l'individu à l'écosystème »
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Guy Woodward, Bo Ebenman, Mark C. Emmerson, José Mª Montoya, J. M. Olesen, A. Valido et Philip H. Warren
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : De Ruiter, P.C. Wolters, V. & Moore, J.C. (eds) Réseaux trophiques dynamiques. Presse académique, p.179-97
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Chaos dans la dynamique des chimioton
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Andreea Munteanu et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Document de travail de l'Institut de Santa Fe, 05-05-017
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Le régime de compétition et d'introduction façonne les communautés d'oiseaux exotiques à Hawaï
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Javier G.P. Gamarra, José Mª Montoya, David Alonso et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Invasions biologiques, 7(2), 297-307
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Percolation d'espace dans les forêts tropicales
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé, Fede Bartumeus et Javier G.P. Gamarra
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Oikos, 110(1), 177-185
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Les graphiques comme modèles d'organisation biochimique à grande échelle"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Pau Fernández et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : Bonchev, D. & Rouvray, D. H. (éd.) Complexité en chimie, biologie et écologie. Springer Science, p.155-89
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Langue : Syntaxe gratuite ?
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Nature, 434(7031), 289
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Dynamique de croissance logarithmique dans les réseaux logiciels
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Lettres Europhysiques, 72(5), 858-864
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Motifs de réseau dans les graphes informatiques : une étude de cas en architecture logicielle
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Examen physique E, 72(2), 026107
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • "Perturbations et effets indirects dans les réseaux trophiques complexes"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      José Mª Montoya, Mark C. Emmerson, Ricard V. Solé et Guy Woodward
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Dans : De Ruiter, P.C. Wolters, V. & Moore, J.C. (eds) Réseaux trophiques dynamiques Presse académique, p.167-78
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    • Topologie, bricolage et évolution du réseau de facteurs de transcription humains
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Carlos Rodríguez-Caso, Miguel A. Medina et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Journal de la FEBS, 272(24), 6423-6434
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Une nouvelle science pour un monde connecté
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Anthropologie actuelle, 45(4), 565-566
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Buchanan, Marc (2003). Nexus : Small Worlds et la théorie révolutionnaire des réseaux. Société WW Norton &
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Une erreur catastrophe dans le cancer ?
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ricard V. Solé et Thomas S. Deisboeck
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Journal de biologie théorique, 228(1), 47-54
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Solution analytique du modèle de Hubbell de dynamique communautaire locale
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Alan J. McKane, David Alonso et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Biologie théorique des populations, 65(1), 67-73
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Complessità Biologica
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Encyclopédie Italiana del Novecento 12, 202-213
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Efficacité et robustesse dans les réseaux de galeries de fourmis
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Jérôme Buhl, Jacques Gautrais, Ricard V. Solé, P. Kuntz, Sergi Valverde, Jean-Louis Deneubourg et Guy Theraulaz
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    The European Physical Journal B - Matière condensée et systèmes complexes, 42(1), 123-129
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Fragmentation de l'habitat et effondrement de la biodiversité dans les communautés neutres
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ricard V. Solé, David Alonso et Joan Saldanya
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Complexité écologique, 1(1), 65-75
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • « Théorie de l'information des réseaux complexes : sur l'évolution et les contraintes architecturales »
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ricard V. Solé et Sergi Valverde
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Dans : Ben-Naim, E. Frauenfelder, H. & Toroczkai, Z. (éd.) Réseaux complexes. Springer-Verlag Berlin, p.189-207
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Forces d'interaction dans les réseaux trophiques : enjeux et opportunités
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Eric L. Berlow, Anje-Margriet Neutel, Joel E. Cohen, Peter C. De Ruiter, Bo Ebenman, Mark Emmerson, Jeremy W. Fox, Vincent AA Jansen, J. Iwan Jones, Giorgos D. Kokkoris, Dmitrii O. Logofet , Alan J. Mckane, José Mª Montoya et Owen Petchey
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Journal d'écologie animale, 73(3), 585-598
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Horizon du chemin critique d'Internet
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Sergi Valverde et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    The European Physical Journal B - Matière condensée et systèmes complexes, 38(2), 245-252
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Modèles dans les réseaux de dépendance syntaxique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ramon Ferrer i Cancho, Ricard V. Solé et Reinhard Köhler
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Examen physique E, 69(5), 051915
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • Échantillonnage de la théorie neutre de la biodiversité de Hubbell
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    David Alonso et Alan J. McKane
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Lettres d'écologie, 7(10), 901-910
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  • L'organisation à grande échelle des réseaux de réactions chimiques en astrophysique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Ricard V. Solé et Andreea Munteanu
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    Lettres Europhysiques, 68(2), 170-176
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Marches adaptatives dans un modèle de réseau de gènes de la morphogenèse : aperçu de l'explosion cambrienne
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé, Pau Fernández et Stuart A. Kauffman
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Revue internationale de biologie du développement, 47(7-8), 685-693
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Le chaos dans une bouteille
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé et David Alonso
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Tendances de l'écologie et de l'évolution, 18(11), 556-557
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Cushing, J.M. et al. (éd.) Chaos en écologie. Dynamique non linéaire expérimentale. Presse académique
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Co-infection et surinfection dans les populations de virus à ARN : un modèle de sélection-mutation
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Joan Saldanya, Santiago F. Elena et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Biosciences mathématiques, 183(2), 135-160
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • "Réseaux complexes en génomique et protéomique"
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Ricard V. Solé et Romualdo Pastor-Satorras
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Dans : Bornholdt, S. & Schuster, H. G. (éd.) Manuel des graphes et des réseaux. Du génome à Internet. Wiley-VCH, p.145-67
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Évolution des réseaux d'interaction protéique grâce à la duplication de gènes
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Romualdo Pastor-Satorras, Eric D. Smith et Ricard V. Solé
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Journal de biologie théorique, 222(2), 199-210
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Complexité du réseau trophique et services écosystémiques de niveau supérieur
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  José Mª Montoya, Miguel A. Rodríguez et Bradford A. Hawkins
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Lettres d'écologie, 6(7), 587-593
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                • Helical Lévy Walks : Ajuster les statistiques de recherche à la disponibilité des ressources en microzooplancton
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Fede Bartumeus, Francesc Peters, Salvador Pueyo, Cèlia Marrassé et Jordi Catalan
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  Actes de l'Académie nationale des sciences, 100(22), 12771-12775

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Premi Ciutat de Barcelona (2003) a l'Investigació Científica (Prix ​​de Barcelone à la recherche scientifique):


                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                13.6 : Systèmes de réaction-diffusion

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Bienvenue au Knop Lab !

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Biologie des systèmes, méiose et transduction du signal

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                La recherche dans notre laboratoire se concentre sur les processus qui régulent la morphogenèse cellulaire et la signalisation cellulaire. Il s'agit de domaines de recherche très actifs et en évolution rapide qui sont motivés par des travaux menés avec des organismes modèles tels que les levures, les mouches ou les vers. Les études fournissent une contribution conceptuelle et expérimentale importante aux travaux menés avec des systèmes de mammifères médicalement pertinents.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Les processus de différenciation cellulaire sont associés à des voies cellulaires qui régulent les fonctions structurelles et les changements métaboliques nécessaires pour que la cellule puisse adopter son nouveau rôle. En utilisant la levure, nous étudions la différenciation cellulaire dans la méiose, où les cellules de levure sont susceptibles d'assembler des spores à l'intérieur des limites de la cellule d'origine. Nous étudions également la réponse cellulaire à des stimuli externes tels que la phéromone d'accouplement de levure. Cela conduit à une stimulation de la cellule via les voies de signalisation de la MAP kinase et à une polarisation nécessaire à la fusion de cellule à cellule.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                La petite taille du génome de la levure et le riche spectre des méthodes disponibles font de cet organisme un système modèle idéal pour déchiffrer la machinerie ou les principes mécanistes derrière ces processus. L'objectif de notre travail est d'obtenir une compréhension au niveau des systèmes des principaux processus moléculaires derrière les aspects réglementaires ainsi que les aspects structurels.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Un moteur important de notre travail est la capacité d'observer les processus cellulaires par des méthodes d'imagerie microscopique, telles que l'imagerie des cellules vivantes. Ici, nous cherchons à étendre continuellement nos méthodes afin de pouvoir imager les fonctions des protéines plus en détail. Nous utilisons des méthodes telles que la spectroscopie de corrélation croisée de fluorescence (FCS/FCCS), l'imagerie de durée de vie de fluorescence (FLIM) et d'autres techniques dites F, afin d'obtenir des informations sur les biomolécules et leurs partenaires d'interaction dans leur environnement naturel. Nous combinons ces méthodes d'imagerie fonctionnelle à haut contenu avec des approches génétiques et génomiques pour explorer les processus d'intérêt.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Nous nous concentrons actuellement sur les domaines suivants :

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1. Nous aimerions comprendre dans quelle mesure la partition spatiale des cellules par des mécanismes de réaction-diffusion contribue à la régulation des processus de transduction du signal.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                2. Nous aimerions comprendre la dimension évolutive des mécanismes moléculaires. En comparant la situation des espèces apparentées, nous pouvons obtenir un aperçu des contraintes qui façonnent des processus particuliers.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                3. Nous développons de nouvelles approches et méthodes microscopiques afin d'améliorer les études systémiques sur la fonction des protéines au sein de processus complexes en utilisant de nouvelles méthodes d'imagerie ou de criblage à haut contenu.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Meurer M, Duan Y, Sass E, Kats I, Herbst K, Buchmuller BC, Dederer V, Huber F, Kirrmaier D, tefl M, Van Laer K, Dick TP, Lemberg MK, Khmelinskii A, Levy ED, Knop M. (2018) Bibliothèque C-SWAT à l'échelle du génome pour le marquage du génome de la levure à haut débit. Méthodes Nat. 15 août 2018(8) : 598-600. doi: 10.1038/s41592-018-0045-8. Publication en ligne du 9 juillet 2018. PubMed PMID : 29988096. (voir résumé)

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Kats I, Khmelinskii A, Kschonsak M, Huber F, Knie RA, Bartosik A, Knop M. (2018) Cartographie des signaux et des voies de dégradation dans un N-terminome eucaryote. Cellule M. Mol. 2018 mai 370(3) : 488-501.e5. doi:10.1016/j.molcel.2018.03.033. PubMed PMID : 29727619. (voir Résumé)

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Theer P, Dragneva D, Knop M. (2016) & piSPIM: imagerie de feuille de lumière isotrope haute résolution NA dans des boîtes de culture cellulaire. Sci Rep. 2016 sept. 136:32880. doi: 10.1038/srep32880. PubMed PMID : 27619647 PubMed Central PMCID : PMC5020645. (voir résumé)

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Huber F, Bunina D, Gupta I, Khmelinskii A, Meurer M, Theer P, Steinmetz LM, Knop M. (2016) Contrôle de l'abondance des protéines par transcription antisens non codante. M. Cell Rep. 2016 juin 2115(12):2625-36. doi:10.1016/j.celrep.2016.05.043. Publication en ligne du 9 juin 2016. PubMed PMID : 27292640 PubMed Central PMCID : PMC4920891 (voir résumé)


                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Khmelinskii A, Blaszczak E, Pantazopoulou M, Fischer B, Omnus DJ, Le Dez G, Brossard A, Gunnarsson A, Barry JD, Meurer M, Kirrmaier D, Boone C, Huber W, Rabut G, Ljungdahl PO, Knop M. ( 2014) Contrôle de la qualité des protéines au niveau de la membrane nucléaire interne. Nature 516 : 410-413 (voir Résumé)


                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Les références

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Alori, E.T., Glick, B.R. et Babalola, O.O. (2017). Solubilisation microbienne du phosphore et son potentiel d'utilisation en agriculture durable. De face. Microbiole. 8:971. doi: 10.3389/fmicb.2017.00971

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Appenzeller, B.M.R., Batté, M., Mathieu, L., Block, J.C., Lahoussine, V., Cavard, J., et al. (2001). Effet de l'ajout de phosphate à l'eau potable sur la croissance bactérienne dans les canalisations légèrement et fortement corrodées. Eau Rés. 35, 1100�. doi: 10.1016/S0043-1354(00)00337-7

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Beech, I.B., et Sunner, J. (2004). Biocorrosion : vers la compréhension des interactions entre biofilms et métaux. Cour. Avis. Biotechnologie. 15, 181&# x2013186. doi: 10.1016/j.copbio.2004.05.001

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Berger, P.S., LeChevallier, M.W. et Reasoner, D.J. (1992). �teurs qui favorisent la croissance du biofilm,” dans Contrôle de la croissance du biofilm dans le système de distribution d'eau potable, 1ère édition, éd. Agence de protection de l'environnement des États-Unis (Washington, DC : Agence de protection de l'environnement des États-Unis), 68.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Bremer, P.J., Webster, B.J. et Brett Wells, D. (2001). Biocorrosion du cuivre dans l'eau potable. J. Ame. Assoc. 93, 82�. doi: 10.1002/j.1551-8833.2001.tb09269.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Chen, X. et Stewart, P.S. (1996). La pénétration du chlore dans le biofilm artificiel est limitée par une interaction réaction-diffusion. Environ. Sci. Technol. 30, 2078�. doi: 10.1021/es9509184

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Cox, M.P., Peterson, D.A. et Biggs, P.J. (2010). SolexaQA : évaluation de la qualité en un coup d'œil des données de séquençage Illumina de deuxième génération. BMC Bioinformatique 11:485. doi: 10.1186/1471-2105-11-485

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Deines, P., Sekar, R., Husband, P.S., Boxall, J.B., Osborn, A.M. et Biggs, C.A. (2010). Une nouvelle conception de coupon pour l'analyse simultanée de la formation de biofilm microbien in situ et de la structure de la communauté dans les systèmes de distribution d'eau potable. Appl. Microbiole. Biotechnologie. 87, 749�. doi: 10.1007/s00253-010-2510-x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Donlan, R.M. et Costerton, J.W. (2002). Biofilms : mécanismes de survie de micro-organismes cliniquement pertinents. Clin. Microbiole. Tour. 15, 167�. doi: 10.1128/CMR.15.2.167

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Douterelo, I., Calero-Preciado, C., Soria-Carrasco, V. et Boxall, J. B. (2018a). Séquençage du métagénome complet des réseaux de distribution d'eau potable chlorée. Environ. Sci. 4, 2080�. doi: 10.1039/C8EW00395E

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Douterelo, I., Fish, K. E. et Boxall, J. B. (2018b). Succession de communautés bactériennes et fongiques au sein des biofilms d'un réseau de distribution d'eau potable chlorée. Eau Rés. 141, 74&# x201385. doi: 10.1016/j.watres.2018.04.058

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Douterelo, I., Mari, S., Loza, V. et Boxall, J. (2016a). Dynamique de repousse des biofilms dans les réseaux de distribution d'eau potable. Appl. Environ. Microbiole. 82, 4155&# x20134168. doi: 10.1128/AEM.00109-16

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Douterelo, I., Jackson, M., Solomon, C. et Boxall, J. (2016b). Analyse microbienne de la formation de biofilms in situ dans les réseaux de distribution d'eau potable : implications pour la surveillance et le contrôle de la qualité de l'eau potable. Appl. Microbiole. Biotechnologie. 100, 3301�. doi: 10.1007/s00253-015-7155-3

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Douterelo, I., Sharpe, R. L. et Boxall, J. B. (2013). Influence des régimes hydrauliques sur la structure et la composition des communautés bactériennes dans un système expérimental de distribution d'eau potable. Eau Rés. 47, 503&# x2013516. doi: 10.1016/j.watres.2012.09.053

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Edwards, M. (2014). Mort fœtale et taux de natalité réduits associés à l'exposition à de l'eau potable contaminée par le plomb. Environ. Sci. Technol. 48, 739&# x2013746. doi: 10.1021/es4034952

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Estrada, G.A., Baldani, V.L.D., de Oliveira, D.M., Urquiaga, S. et Baldani, J.I. (2013). Sélection de souches diazotrophes Herbaspirillum et Burkholderia solubilisant le phosphate et leur effet sur le rendement des cultures de riz et l'absorption des nutriments. Sol végétal 369, 115&# x2013129. doi: 10.1007/s11104-012-1550-7

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Fang, W., Hu, J. et Ong, S. (2010). Effets du phosphore sur la désinfection des biofilms dans les réseaux modèles de distribution d'eau potable. J. Santé de l'eau 8, 446�. doi: 10.2166/wh.2009.303

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Fang, W., Hu, J. Y. et Ong, S. L. (2009). Influence du phosphore sur la formation de biofilm dans les réseaux modèles de distribution d'eau potable. J. Appl. Microbiole. 106, 1328&# x20131335. doi: 10.1111/j.1365-2672.2008.04099.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Fish, K. E. et Boxall, J. B. (2018).La dynamique de (re)croissance du microbiome du biofilm dans les réseaux de distribution d'eau potable est influencée par la concentration de chlore. De face. Microbiole. 9:2591. doi: 10.3389/fmicb.2018.02519

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Gomez-Alvarez, V., Teal, T. K. et Schmidt, T. M. (2009). Artefacts systématiques dans les métagénomes de communautés microbiennes complexes. ISME J. 3, 1314&# x20131317. doi: 10.1038/ismej.2009.72

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Gooddy, D.C., Lapworth, D.J., Ascott, M.J., Bennett, S.A., Heaton, T.H.E. et Surridge, B.W.J. (2015). Empreinte isotopique du phosphore dans les approvisionnements en eau potable. Environ. Sci. Technol. 49, 9020�. doi: 10.1021/acs.est.5b01137

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Gordon, C., et Hutchinson, T. (1994). Perspectives mondiales sur le cycle du plomb, du mercure et du cadmium dans l'environnement. Parc d'Elkins, Pennsylvanie : Compagnie de livre.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Gouider, M., Bouzid, J., Sayadi, S. et Montiel, A. (2009). Impact de l'ajout d'orthophosphate sur le développement du biofilm dans les réseaux de distribution d'eau potable. J. Hazard. Mater. 167, 1198&# x20131202. doi: 10.1016/j.jhazmat.2009.01.128

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Hammer, Ø, Harper, D.A.T. et Ryan, P.D. (2001). Logiciel de statistiques paléontologiques PAST pour l'éducation et l'analyse des données. Paléontol. Électron. 4, 1𠄹.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Harold, F.M. (1966). Polyphosphates inorganiques en biologie : structure, métabolisme et fonction. Bactériol. Tour. 30, 772�. doi: 10.1128/mmbr.30.4.772-794.1966

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Hayes, C.R., Incledion, S. et Balch, M. (2008). Expérience au Pays de Galles (Royaume-Uni) de l'optimisation du dosage des orthophosphates pour le contrôle du plomb dans l'eau potable. J. Santé de l'eau 6, 177&# x2013185. doi: 10.2166/wh.2008.044

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Hirota, R., Kuroda, A., Kato, J. et Ohtake, H. (2010). Métabolisme bactérien du phosphate et son application à la récupération du phosphore et aux bioprocédés industriels. J. Biosci. Bioengin. 109, 423&# x2013432. doi: 10.1016/j.jbiosc.2009.10.018

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Hull, N.M., Ling, F., Pinto, A.J., Albertsen, M., Jang, H.G., Hong, P.Y., et al. (2019). Projet microbiome eau potable : est-il temps ? Tendances Microbiol. 27, 670�. doi: 10.1016/j.tim.2019.03.011

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mari, P.S., Boxall, J.B. et Saul, A.J. (2008). Etudes en laboratoire sur les processus conduisant à la décoloration des réseaux de distribution d'eau. Eau Rés. 42, 4309&# x20134318. doi: 10.1016/j.watres.2008.07.026

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Jang, H.J., Choi, Y.J., Ro, H.M. et Ka, J.O. (2012). Effets de l'ajout de phosphate sur les communautés bactériennes du biofilm et la qualité de l'eau dans les réacteurs annulaires équipés de tuyaux en acier inoxydable et en fonte ductile. J. Microbiol. 50, 17&# x201328. doi: 10.1007/s12275-012-1040-x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Jensen, L.J., Julien, P., Kuhn, M., von Mering, C., Muller, J., Doerks, T., et al. (2008). eggNOG : construction et annotation automatisées de groupes de gènes orthologues. Acides nucléiques Res. 36, D250�.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Kasahara, S., Maeda, K. et Ishikawa, M. (2004). Influence du phosphore sur l'accumulation de biofilm dans les réseaux de distribution d'eau potable. Eau Sci. Technol. 4, 389�. doi: 10.2166/ws.2004.0130

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Kato, J., Yamada, K., Muramatsu, A., Hardoyo et Ohtake, H. (1993). Amélioration génétique de Escherichia coli pour une meilleure élimination biologique du phosphate des eaux usées. Appl. Environ. Microbiole. 59, 3744�. doi: 10.1128/aem.59.11.3744-3749.1993

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Keegan, K.P., Glass, E.M. et Meyer, F. (2016). MG-RAST, un service de métagénomique pour l'analyse de la structure et de la fonction des communautés microbiennes. Méthodes Mol. Biol. 1399, 207&# x2013233. doi: 10.1007/978-1-4939-3369-3_13

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Keinänen, M. M., Korhonen, L. K., Lehtola, M. J., Miettinen, I. T., Martikainen, P. J., Vartiainen, T., et al. (2002). La structure de la communauté microbienne des biofilms d'eau potable peut être affectée par la disponibilité du phosphore. Appl. Environ. Microbiole. 68, 434�. doi: 10.1128/AEM.68.1.434-439.2002

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Khoshmanesh, A., Hart, B.T., Duncan, A. et Beckett, R. (2002). L'absorption de luxe du phosphore par les bactéries des sédiments. Eau Rés. 36, 774&# x2013778. doi: 10.1016/S0043-1354(01)00272-X

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Kirisits, M. J., Evans, A. et Lauderdale, C. (2013). Effet de la limitation du phosphore sur la production de substances polymériques extracellulaires (EPS) par les bactéries de l'eau potable. Biol. Traitement. Symposium. 2013, 59�.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Kuroda, A., Murphy, H., Cashel, M. et Kornberg, A. (1997). Les guanosine tétra- et pentaphosphate favorisent l'accumulation de polyphosphate inorganique dans Escherichia coli. J. Biol. Chem. 272, 21240�. doi: 10.1074/JBC.272.34.21240

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Lau, H. Y. et Ashbolt, N. J. (2009). Le rôle des biofilms et des protozoaires dans la pathogenèse de Legionella : implications pour l'eau potable. J. Appl. Microbiole. 107, 368�. doi: 10.1111/j.1365-2672.2009.04208.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Liu, G., Bakker, G.L., Li, S., Vreeburg, J.H.G., Verberk, J.Q.J.C., Medema, G.J., et al. (2014). Le pyroséquençage révèle des communautés bactériennes dans le système de distribution d'eau potable non chlorée : une étude intégrale de l'eau en vrac, des solides en suspension, des dépôts meubles et du biofilm de la paroi des tuyaux. Environ. Sci. Technol. 48, 5467�. doi: 10.1021/es5009467

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Liu, S., Gunawan, C., Barraud, N., Rice, S. A., Harry, E. J. et Amal, R. (2016). Comprendre, surveiller et contrôler la croissance du biofilm dans les réseaux de distribution d'eau potable. Environ. Sci. Technol. 50, 8954�. doi: 10.1021/acs.est.6b00835

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Lytle, D.A., Sarin, P. et Snoeyink, V.L. (2003). L'effet du chlorure et de l'orthophosphate sur la libération de fer d'un tuyau en fonte d'un système de distribution d'eau potable. Proc. Qual. de l'eau Technol. Conf. 54, 2496�.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mah, T.-F. C., et O’Toole, G.A. (2001). Mécanismes de résistance du biofilm aux agents antimicrobiens. Tendances Microbiol. 9, 34�. doi: 10.1016/S0966-842X(00)01913-2

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mathieu, L., Paris, T., et Block, J.-C. (2019). “Microbiome des réseaux de distribution d'eau potable,” en Réfugiés et migration forcée dans la Corne et l'Afrique de l'Est, éds J.D. Schmidt, L. Kimathi et M.O. Owiso (Berlin : Springer), doi : 10.1007/978-3-030-16775-2_9

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mavropoulos, E., Rocha, N.C.C., Moreira, J.C., Rossi, A.M. et Soares, G.A. (2004). Caractérisation de l'évolution de phase lors de l'immobilisation du plomb par l'hydroxyapatite synthétique. Mater. Caractérisation 53, 71�. doi: 10.1016/j.matchar.2004.08.002

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mcneill, L.S., et Edwards, M. (2001). Corrosion des tuyaux en fer dans les systèmes de distribution. Confiture. Assoc. 93, 88�. doi: 10.1002/j.1551-8833.2001.tb09246.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                McNeill, L. S. et Edwards, M. (2002). Utilisation d'inhibiteurs de phosphate dans les services publics américains. Confiture. Assoc. 94, 57�. doi: 10.1002/j.1551-8833.2002.tb09506.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Miettinen, I.T., Vartiainen, T. et Martikainen, P.J. (1997). Phosphore et croissance bactérienne dans l'eau potable. Appl. Environ. Microbiole. 63, 3242�. doi: 10.1128/aem.63.8.3242-3245.1997

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Neu, T.R., et Lawrence, J.R. (2010). “Substances polymériques extracellulaires dans les biofilms microbiens,” dans Glycobiologie microbienne, eds A. Moran, P. Brennan, O. Holst et M. von Itzstein (San Diego, CA : Elsevier Inc), 733&# x2013758. doi: 10.1016/B978-0-12-374546-0.00037-7

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Neufeld, J.D., Vohra, J., Dumont, M.G., Lueders, T., Manefield, M., Friedrich, M.W., et al. (2007). Sondage d'isotopes stables de l'ADN. Nat. Protoc. 2, 860&# x2013866. doi: 10.1038/nprot.2007.109

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Noh, J. H., Yoo, S. H., Son, H., Fish, K. E., Douterelo, I. et Maeng, S. K. (2019). Effets du phosphate et du peroxyde d'hydrogène sur les performances d'un filtre biologique à charbon actif pour une biofiltration améliorée. J. Hazard. Mater. 388:121778. doi: 10.1016/j.jhazmat.2019.121778

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Payne, S.J., Piorkowski, G.S., Hansen, L.T. et Gagnon, G.A. (2016). Impact de l'orthophosphate de zinc sur des biofilms d'eau potable simulés influencés par le plomb et le cuivre. J. Environ. Ing. 142, 1𠄹. doi: 10.1061/(ASCE)EE.1943-7870.0001031

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Persson, P., Nilsson, N., et Sjöx00F6berg, S. (1996). Structure et liaison des ions orthophosphates à l'interface oxyde de fer-aqueux. J. Interface colloïdale Sci. 177, 263&# x2013275. doi: 10.1006/jcis.1996.0030

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Potgieter, S.C., Dai, Z., Venter, S.N., Sigudu, M. et Pinto, A.J. (2020). Métabolisme microbien de l'azote dans les réservoirs d'eau potable chloraminés. mSphère 5:e00274-20. doi: 10.1128/msphere.00274-20

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Rubulis, J., et Juhna, T. (2007). Évaluer le potentiel de contrôle du biofilm dans les systèmes d'approvisionnement en eau par l'élimination du phosphore de l'eau potable. Eau Sci. Technol. 55, 211&# x2013217. doi: 10.2166/wst.2007.261

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Saritha, M., et Prasad Tollamadugu, N.V.K.V. (2019). “Le statut de la recherche et de l'application des biofertilisants et des biopesticides : scénario global,” en Développements récents en microbiologie appliquée et en biochimie, éd. B. Viswanath (Amsterdam : Elsevier Inc), doi : 10.1016/B978-0-12-816328-3.00015-5

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Sathasivan, A., Ohgaki, S., Yamamoto, K. et Kamiko, N. (1997). Rôle du phosphore inorganique dans le contrôle de la repousse dans le système de distribution d'eau. Eau Sci. Technol. 35, 37�. doi: 10.1016/S0273-1223(97)00149-2

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Schock, M.R. (1989). Comprendre les stratégies de contrôle de la corrosion pour le plomb. Confiture. Assoc. 81, 88�. doi: 10.1002/j.1551-8833.1989.tb03244.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Schock, M.R., et Clement, J.A. (1996). Contrôle du plomb et du cuivre avec de l'orthophosphate sans zinc. Un m. Assoc. 112, 20&# x201342.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Sharma, S.B., Sayyed, R.Z., Trivedi, M.H. et Gobi, T.A. (2013). Microbes solubilisants du phosphate : approche durable pour gérer la carence en phosphore dans les sols agricoles. J. Clin. Microbiole. 2, 1�. doi: 10.1186/2193-1801-2-587

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Sidat, M., Bux, F. et Kasan, H.C. (1999). Accumulation de polyphosphates par des bactéries isolées de boues activées. Eau SA 25, 175&# x2013179.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Smith, S. E. et Read, D. (éd.). (2008). Nutrition du phosphore et des cations basiques, accumulation de métaux lourds et relations hydriques des plantes ectomycorhiziennes, Symbiose mycorhizienne, 3e édition, éd., Sally E. Smith et David Read (Cambridge, MA : Academic press), 349&# x2013385. doi: 10.1016/B978-0-12-370526-6.50012-X

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Szewzyk, U., Szewzyk, R., Manz, W. et Schleifer, K.-H. (2000). Sécurité microbiologique de l'eau potable. Annu. Rév. Microbiol. 54, 81�. doi: 10.1146/annurev.micro.54.1.81

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Wilczak, A., Jacangelo, J.G., Marcinko, J.P., Odell, L.H. et Kirmeyer, G.J. (1996). Présence de nitrification dans les réseaux de distribution chloraminés. Confiture. Assoc. 88, 74�. doi: 10.1002/j.1551-8833.1996.tb06586.x

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Mots clés : biofilms, phosphate, eau potable, réseaux de distribution, métagénomique entière

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Citation : Rosales E, Del Olmo G, Calero Preciado C et Douterelo I (2020) Le dosage de phosphate dans les systèmes de distribution d'eau potable favorise les changements dans la structure du biofilm et la diversité génétique fonctionnelle. De face. Microbiole. 11:599091. doi: 10.3389/fmicb.2020.599091

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Reçu : 22 septembre 2020 Accepté : 24 novembre 2020
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Publication : 17 décembre 2020.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Pascal E. Saikaly, Université des sciences et technologies King Abdullah, Arabie saoudite

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Dong Li, Université de Californie, Santa Barbara, États-Unis
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Graciela Gonzalez-Gil, Université des sciences et technologies King Abdullah, Arabie saoudite

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Copyright © 2020 Rosales, Del Olmo, Calero Preciado et Douterelo. Il s'agit d'un article en libre accès distribué sous les termes de la Creative Commons Attribution License (CC BY). L'utilisation, la distribution ou la reproduction dans d'autres forums est autorisée, à condition que le ou les auteurs originaux et le ou les titulaires des droits d'auteur soient crédités et que la publication originale dans cette revue soit citée, conformément aux pratiques académiques acceptées. Aucune utilisation, distribution ou reproduction non conforme à ces conditions n'est autorisée.


                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Voir la vidéo: Coding Challenge #13: Reaction Diffusion Algorithm in (Décembre 2021).